WormBase Tree Display for Gene: WBGene00006771
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WBGene00006771 | SMap | S_parent | Sequence | Y71G12B | |||||
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Identity | Version | 3 | |||||||
Name | CGC_name | tln-1 | Person_evidence | WBPerson110 | |||||
Sequence_name | Y71G12B.11 | ||||||||
Molecular_name (21) | |||||||||
Other_name | unc-35 | Person_evidence | WBPerson261 | ||||||
Ce Talin | Paper_evidence | WBPaper00036199 | |||||||
CELE_Y71G12B.11 | Accession_evidence | NDB | BX284601 | ||||||
Public_name | tln-1 | ||||||||
DB_info | Database | WormFlux | gene | WBGene00006771 | |||||
NDB | locus_tag | CELE_Y71G12B.11 | |||||||
Panther | gene | CAEEL|WormBase=WBGene00006771|UniProtKB=G5EGK1 | |||||||
family | PTHR19981 | ||||||||
NCBI | gene | 171736 | |||||||
RefSeq | protein | NM_001262110.3 | |||||||
NM_001313547.3 | |||||||||
NM_001373653.2 | |||||||||
NM_001313545.3 | |||||||||
NM_001392973.1 | |||||||||
NM_058485.8 | |||||||||
NM_001381251.1 | |||||||||
TREEFAM | TREEFAM_ID | TF314677 | |||||||
TrEMBL | UniProtAcc | G4S9F5 | |||||||
G5EGK1 | |||||||||
Q95XN3 | |||||||||
A0A0K3ATT6 | |||||||||
A0A0K3AQU9 | |||||||||
W6SBK6 | |||||||||
A0A0K3AUD9 | |||||||||
UniProt_GCRP | UniProtAcc | G5EGK1 | |||||||
Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
History | Version_change | 1 | 07 Apr 2004 11:29:42 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from geneace | ||
2 | 12 Aug 2011 14:19:05 | WBPerson2970 | Name_change | CGC_name | tln-1 | ||||
Other_name | unc-35 | ||||||||
3 | 31 Jan 2013 09:04:22 | WBPerson2970 | Event | Acquires_merge | WBGene00022151 | ||||
Acquires_merge | WBGene00022151 | ||||||||
Status | Live | ||||||||
Gene_info | Biotype | SO:0001217 | |||||||
Gene_class | tln | ||||||||
Reference_allele | WBVar00143069 | ||||||||
Allele (384) | |||||||||
Possibly_affected_by | WBVar02158438 | ||||||||
Legacy_information | e259 : loopy irregular forward movement poor backing; active; slightly thin. ES2. ME2. NA1. | ||||||||
[C.elegansII] e259 : loopy irregular forward movement, poor backing; active; slightly thin. ES2. ME2. NA1. [Brenner 1974] | |||||||||
Strain | WBStrain00027032 | ||||||||
WBStrain00032143 | |||||||||
WBStrain00005542 | |||||||||
WBStrain00006169 | |||||||||
WBStrain00047172 | |||||||||
RNASeq_FPKM (74) | |||||||||
GO_annotation | 00000568 | ||||||||
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Ortholog (45) | |||||||||
Paralog | WBGene00006836 | ||||||||
Structured_description | Automated_description | Predicted to enable integrin binding activity. Involved in negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway; regulation of vulval development; and vulval cell fate specification. Located in basement membrane; contractile fiber; and lateral plasma membrane. Expressed in several structures, including Psub4; Z2; Z3; distal tip cell; and vulval cell. Is an ortholog of human TLN2 (talin 2). | Paper_evidence | WBPaper00065943 | |||||
Curator_confirmed | WBPerson324 | ||||||||
WBPerson37462 | |||||||||
Inferred_automatically | This description was generated automatically by a script based on data from the WS292 version of WormBase | ||||||||
Date_last_updated | 24 Apr 2024 00:00:00 | ||||||||
Molecular_info | Corresponding_CDS | Y71G12B.11a | |||||||
Y71G12B.11b | |||||||||
Y71G12B.11c | |||||||||
Y71G12B.11d | |||||||||
Y71G12B.11e | |||||||||
Y71G12B.11f | |||||||||
Y71G12B.11g | |||||||||
Corresponding_transcript | Y71G12B.11a.1 | ||||||||
Y71G12B.11b.1 | |||||||||
Y71G12B.11c.1 | |||||||||
Y71G12B.11d.1 | |||||||||
Y71G12B.11e.1 | |||||||||
Y71G12B.11f.1 | |||||||||
Y71G12B.11g.1 | |||||||||
Other_sequence | JI481552.1 | ||||||||
PTC03592_1 | |||||||||
MP02104 | |||||||||
Tcir_isotig08682 | |||||||||
PT04127 | |||||||||
Dviv_isotig25387 | |||||||||
CR08990 | |||||||||
RS05963 | |||||||||
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EX560976.1 | |||||||||
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Hbac_isotig03931 | |||||||||
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MC00935 | |||||||||
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Tcol_isotig20198 | |||||||||
CRC10720_1 | |||||||||
Oden_isotig18960 | |||||||||
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Name_isotig03977 | |||||||||
FC548773.1 | |||||||||
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Oden_isotig19281 | |||||||||
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Acan_isotig20203 | |||||||||
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JI163904.1 | |||||||||
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Tcol_isotig08229 | |||||||||
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Dviv_isotig09070 | |||||||||
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TSC07430_1 | |||||||||
Dviv_isotig15750 | |||||||||
Tcol_isotig24020 | |||||||||
CB013256.1 | |||||||||
FC545828.1 | |||||||||
Associated_feature (33) | |||||||||
Experimental_info | RNAi_result (50) | ||||||||
Expr_pattern (8) | |||||||||
Drives_construct | WBCnstr00042808 | ||||||||
Microarray_results (50) | |||||||||
Expression_cluster (203) | |||||||||
Interaction (21) | |||||||||
Map_info | Map | I | Position | -13.1715 | |||||
Well_ordered | |||||||||
Positive | Positive_clone | Y71G12B | Inferred_automatically | From sequence, transcript, pseudogene data | |||||
Mapping_data | 2_point | 3 | |||||||
258 | |||||||||
7147 | |||||||||
7168 | |||||||||
Multi_point | 2 | ||||||||
348 | |||||||||
350 | |||||||||
3659 | |||||||||
3660 | |||||||||
3932 | |||||||||
5723 | |||||||||
Pos_neg_data | 526 | ||||||||
3764 | |||||||||
6288 | |||||||||
Reference (24) | |||||||||
Method | Gene |