Questions, Feedback & Help
Send us an email and we'll get back to you ASAP. Or you can read our Frequently Asked Questions.

WormBase Tree Display for Feature: WBsf968236

expand all nodes | collapse all nodes | view schema

Name Class

WBsf968236SMapS_parentSequenceY59A8B
Sequence_detailsFlanking_sequencesccgccgaaaactttcaattccggcaaatttcagattttccgatttgccggaatttttctattccggcaagttgccgattttccgctttgccggaactttccaattccggcaaattgccgatttttcgatatgccggaaattttcaattccggcaaattgccgatttgccggaatgtttctattccggcaagttgccgattttcggaaaattttcatttttggcgatttgctggaaattttcaattctggcaaattgccggtttgccgaatttgcacgaaattttcattttcggcaaattgtaggcttgcctaattttccggaaaaatttaaatttcggcaaaaagccgatttgccggaatatatgaatttcggcgaactgctgatttgacgaaaattatcaattttggcaatttgccggaaattttcatttttggcaaatttcaggttttccgatttgccggacagtttcaaattcggcaaattgcggatctacctgaaatactccattcaggtttgcctaatttgccggaaaaaaaattaagttccggtttgccgttttgccggaaatattcagttcccgcaagttgctgatttggtggaaattgtcgtcttcggcaaatttccggtttccccatttgccggaaatgttaatttttgccaaattgccgatttgccggaatatataaattccggcgaattgctgatttgatgggaattatcaattttggcaatttgccggaaatgttcatttttggaaaattgcccatttaccggaaattttcatttttggaaaatttcaggtttgcccaattgcgggaaattatcgattccggcaaattgcatgtttgcccaatttgccgaaaactttcaattccggcaaattgccgatttttcgattccggcacatttcagattttccaatatgccggatatttgcaattccggcaatatgccgattttccgctttgccggaactttccaataccggcaaattgccgattttccgatatgccggaaattttcaattccggcaaattgccgatttgccggaatttttctattccggcaagttgccgattttcggaaaattttcatttttggcgatttgccggaaattttcaattccggccagttgccgatttgccagaaattataaattccggccagttgccgatttgccagaaattatgaattccggcaaatttccattttgccggaaattttcaattccggcaaatgcaggtttgcctaatttgccggaaattttcaattccggccagttgccgatttgccagaaattatgaattccggcaaatttccattttgccggaaattttctattccggcaaatttccattttgccggaaattttcaattccggcaaatgcaggtttgcctaatttgccggaaaatgttccattccggcaatctgccgatttttggcgatttgccggaaattttctgcaaatcgcatgatgattgcctaatttgccggaataattcaattccggcaaaatgccaaatgcttgccacccacctctctgtttcatactagtttatttcgaaaaaaaaatttttttctgaaataaaaaaaaatacactaaattttttgaaaattgaaatttttaattaaaaaaaactttttttttttcagaaaaccagtgaccacaatgagaactccagccgccaccccggctgctccaccaacccgtccaactccatcccgttcttcagctgctccgagagcaacagctccaactccaacagcagcacctccaaaaacttgtgcaccgcccgttcgttctgcatcaaccgtagcagcggctgctgctgctgcaccaccgggagtcgatatggcgacatttaataaattaaaagaagaactggaagaagttacacgtcagctgacagaatctgacaatgttattgcaagtctggaaaaagaaagagacttttattttagtaaacttcgaacgattgaagttatttgtcaggataatgaatcgattggaaatgttgaagttaatcgagttttggaggtaaaaattgatgaaaattgggaaaaactaccgaaagtagcctgaaatttggatcagggatgtgcggcaaatttgccgaatttgccgaatttgccgaatttgccgagctcggcaaatttcaaaaaagtagatttgccgaatttgccgcacacgtcaaaaattttacagtacaattttgactaaaactattgattttttagccaaaaatttagtaaaatgacacaaaattgacttagttttatgcttaaacagacatactacgcggaacttattcagaaaccagatgtgtgttaagaattcagtagatttggtgctccaaaaaacataaaaaatatcaaattttttcgagttttgcacggcaaatttgccgaatttgccgtttgccgagctcggcaaattttgagatttgccgcacacccctgatttggatttagaatgtttagaaaagagcaattttagagataaaattcaagaaatttaaaaaattccgaaatttttgataattgctaatttccaactatatcaaagtcaaaaaagtgagacttttttgaaaattttgattttttttaatttagaaaattctcgaaaatttgaaaaaaaattcaaattattcggaaaattgcgtatatttgtgtgaaaaataaaaaaaaataatttaaaaattccgaaaatttgaagaaagtatgtttaaaacatttttttaattgaaaaattccggaaatttcaaaaaaaaaattttgtttgaaaacatatgaaaaactatttaaagtatcaatttttagataaaattcaagaaatttcaaaaattccgaaaattccaaaatttttgataattgctcatttccaacaatatcaaaaatgaaaaaaagtgaaaattttgttgaaaatttaaatttttttttttaatttagaaaattctcggaaaattgcgtatatttgtgtgaaaaattcctaaagtgagatttttcggaaattttcatttttggcgatttgcctaatatgccggaaattatcaattccggcaaattgccgtttttccgatttgccggaaaaatttgaaacatttgggaaaaaaattgtttttgaaatttttaaaaataattatctatgtaaattaaaaaaaatatatatatatgtatataacttttttatttaaaaattccgaaaattcgaaaaaaaaacatatgtttggaaatttcaacttttttatttacaaaaaaatttaaacttcaaaaaaaatctgctttgaaaatttatgaaaaaatatttaaagtagcatatatatttgcaaaacattgaaaatttggctgaaaaaactgaaaatttaatcaattttgaaaataaaaaaatgtaaattttgaaaataaaaaaaactttcaaaatttttgataattgctaatttccaactatatcaaaagtaaaaaagtgagactttttttgaaaatttaaattttttaaatttagaaaattctcggaaatttgaaaaaaaagaacaattattcgtaaaattgcaaatatttgtgtggaaaatgtgtggaaattaaaaaaaaatttcatctaaaaattcccaaaatttgaagaaagtatgtttgaaacatttcattaattttttttataattaaattccggaaatttcaaaaaaaaaaattttgtttgaaaacatatgaaaaactatttaaagtatcatcaatttttagataaaattcaagaaatttcaaaaattccaaaatttttgataattgctaatttccaactatatcaaagtcaaaaaagtgaaaattttgttgaaaattttgaattttttttaaattcagaaactttataagaaaaacaaccaaaggtaactttttagtatattttttcattggaaattttgaagaaaattttttaaaaataaaacttctcgaaaatttgaaaaaaaaataaaattcgaaagttacgtatatttgtgtgaaaaaaacgttttttatttcaatttaaaaaattcctaaaattttgaaaaaatatcaaccgaaaaaaaacattttttttaaatgaaaattctcggaaagtagcgaaaaattccgaaagtgatgcatattcacaaaaaaaattattttttatttaataaaaaaacgtaattttgaaacatttttttgtttaaaaatgtttttttttatttacaaaaaaaattaaaattccggaaaagtctgaaattgaatattaaaaaaaaaaagaaaacagcaatttatcccttaattttgaaaaatattcaatttcgacattttactttttttaaaattagatttaaaatttctgaaaatttgcagaaaaaactgaaaaaataactaccccgaaaaaaaagttcttaaaaacatatttccaggttctctacgagacggaagaaggattcgcaccaccagaagacgaggcaaatggcggagcagaagccgaagaattctaaactatttaatattttctctattgtttaattccagctttcaagccaagcttctacccaaacacttcaattttactcccaaaaaaatatgcgattttacaatgttatatttcaccgaaaaccccctctgcttataattatagttaacttattaattttcatgaacttattcaataactgcaccaaattggccgccgcttcttcttttccacttgaaattttcagtttttcttttttcattcttccatcccaacacctatgacattgtcagtattttaattgattggctttcaattttttttcgattttaaaaatcatttcctttttttcaccgaacatttaacgcttttttctaattgttacgtcgtgcttttctttgtgctaaaataaattatgatatttaaaaaagaattttgcttccttcaaacaaaaatttcaaaaaatgatgggtctgctaaatacattttgtagtttgtagtctggcatacccacttagtaaaatcatcagtttttgctgtaattttgaacagttttcccttaaattttgcattttctcgggatttgaatgtgacaattcatgaaaatttactcaaaaaatcgatttttcgcatagaaaatattggaattttgggatttaaatttgtagtcgttgatcatattttcaaaatgctccaaacagacaaattttaagtttagagcaaaaattgattgacaaaacgatgaaaatatgcccaacgactccaaattccaatttttaaagtctttatctacactcattttttctattttcttttctgagcacaccataactggttagatgcttgggtctgctaaatatttttgtgtagtttgtagtctggcaaacccactcggtgaaaatggccaattttgctgtaattttaagaggttatcctgatttttggcgggaaaaatctcaaaatgtgcattttctcggagcatgtaattgaaaatttactcaaaaaaatcgatttttcgcttagaaaatatttgaattcggcaaaattatgcataaaatcacaatttaacccgtctgaaaacccgaaaatccacatttttcatcgattttctgttaaaaatctgcttattttcacctgaaaacacaaaatttagtcgaaaaaatgatgggtcggctaaataattttgtgtagtttgtagtctagcagaccggaaacgattatttttcgatttttcttttttttttaacccaaaagtttgggtctgctaaacattgttgtgtagtttgtagtgtggcaggcccaattgcttcaacattggactgtgtcactggaatttgagatttagaaataatttattgcgcgtagtaaaactaatcaagtgaacattttgaacgggtgaaaaagcgaataaataaaaaataaataaatatttaaaaaatgcgtgggcggtggaatgtacaaattatcgattgatgattctcaacataatccttcatcatcgtcatcttcttgtccgtcaccgagtcccgcatttccagacggtgcttttagaattttcatcactcggagatactgaaaaattgaacggtttttaggatgataattcgataaaatgagccaaacctcattgtccatagaccgtagggctccacatttcagtacattctggaaactttcatcatcgccagcctcatagaatccgataagattctcacatacacgtccatcttctgatgtttgaaaatccggagattgactgcaaaaaattgaattttcgatggaattgtttaaattttgattagaaaaaaaaaatcgatttttcaaaaacttacattttttttagagctacgaaattgttttttttgttctgattttttcgaaaaaaaaatggtctgctaaactacaatctacaaaccatttaggtctgctaattattttctgtagtttgtagtctggcagacccacaaatgggtctgccagagtacaaaaactgcaaaaatacagtttttagaattttccgtttttctaacaaaagtgcaaatttacgaaaaatcagcatttttgcaataaaaaactggacaattcggcaaaaaccggtttaaaaaaaatatttccgtgtagtttgtagtttgggtctgccagactacaaactacagaaaataattagcagacctaaatggtttgtagtttgttgtctggcagacccaaactacaaactacacggaaatattttttttaaaccggtttttgccgaattgtccagttttttattgcaaaaatgctgatttttcgtaaatttgcacttttgttagaaaaacggaaaattccaaagacccatttgtgggtctgccagactacaaactacaaaccacttgggtctgctgattatattttgtagtttgtagtctggcagacccaaatcagtttgggtctgccagactacaaactacacaacagcttcgaaaaatcgagtttcgtcgtatttttcgacttcttccgcataaatttcaatttttaataaaatttttcgcgtgtcttcgtaccaaataacccatccataatctttgagagccgccactgaatcttccagagccaaattcactataacaagaccgattccgagttggccaatacgtggatattcctgaaaatcggaaaaatttaaaaaaaatctttgtcaaaatttagaaaattcaaaattcttgtagtttgtagtctagcagaccaattttttaaataaagttgaaaaattcaaattttcgtaaaaatacacggaaaaatcagaaattgattgttttttttgtagtttgtagtctaaaaaatagcacgtcccactataaactacaaaagttcaatttttaaaaaagtgaaaaacaaaaaaaaatcaaaaatttgcaatttttcagaacatccaaaaaaattaaaaaattttgttttttttttcgttttttctatagaattttcgtgtagtttgtagtctatcagtacccgaatttcggcgaatttctcaatttcctcccgaatcgatccgagtgctcctttataatcagtcaattgtagtgataattttgtgatttgtttcaagaaattgctcgccatttttgcacgatccgattgttggaccaaagccaatccacgttggtaaatctgcaaaaaaaattgattttttatcaatcggctgtgcattttctcaggaaattttgtggaaaaaccacggaaaatcgattttttacccagaaaacttgaaaaacaccattttcagagcttttatagccaaaaaatgccgagaatccgaatatttccagttaaaaacgcaaaaaaaaaatcaaaatttagtcgaaaaatatgggtctgctaaatacattttgtagtttgtagtctggcagacccatttggtaaaaatcgtcaattttgctctaattttgagcaattttccagattttttggctggatcactctcaattatgcattttctcgaaaatttgcagaaaaaaatcaattttcacatagaaaatatgcataaaatcacatttttcgccaaaaaaaccgtctaaaaacccaaaaaaatacacattttctgtgagaaacggagttttgccctaaaaatctgctcattttcgtttgaaaactcaaaattttgtcg
Mapping_targetY59A8B
OriginSpeciesCaenorhabditis elegans
VisibleDescriptionSL1 trans-splice leader acceptor site
SO_termSO:0000706
Defined_byDefined_by_analysisRNASeq.elegans.N2.WBls:0000024.Hermaphrodite.WBbt:0007833.PRJNA128465.SRX0282013
RNASeq.elegans.N2.WBls:0000027.Hermaphrodite.WBbt:0007833.PRJNA128465.SRX0282021
RNASeq.elegans.N2.WBls:0000035.Hermaphrodite.WBbt:0007833.PRJNA128465.SRX0282031
RemarkDefined by RNASeq data (example read: SRR068576.14107920.+.SL1 + 16M5S) from RNASeq.elegans.N2.WBls:0000024.Hermaphrodite.WBbt:0007833.PRJNA128465.SRX028201 with 3 reads
Defined by RNASeq data (example read: SRR068577.7425095.+.SL1 + 16M) from RNASeq.elegans.N2.WBls:0000027.Hermaphrodite.WBbt:0007833.PRJNA128465.SRX028202 with 1 reads
Defined by RNASeq data (example read: SRR068578.2139557.+.SL1 + 16M4S) from RNASeq.elegans.N2.WBls:0000035.Hermaphrodite.WBbt:0007833.PRJNA128465.SRX028203 with 1 reads
MethodSL1