Questions, Feedback & Help
Send us an email and we'll get back to you ASAP. Or you can read our Frequently Asked Questions.

WormBase Tree Display for Feature: WBsf968233

expand all nodes | collapse all nodes | view schema

Name Class

WBsf968233SMapS_parentSequenceY59A8B
Sequence_detailsFlanking_sequencesccgccgaaaactttcaattccggcaaatttcagattttccgatttgccggaatttttctattccggcaagttgccgattttccgctttgccggaactttccaattccggcaaattgccgatttttcgatatgccggaaattttcaattccggcaaattgccgatttgccggaatgtttctattccggcaagttgccgattttcggaaaattttcatttttggcgatttgctggaaattttcaattctggcaaattgccggtttgccgaatttgcacgaaattttcattttcggcaaattgtaggcttgcctaattttccggaaaaatttaaatttcggcaaaaagccgatttgccggaatatatgaatttcggcgaactgctgatttgacgaaaattatcaattttggcaatttgccggaaattttcatttttggcaaatttcaggttttccgatttgccggacagtttcaaattcggcaaattgcggatctacctgaaatactccattcaggtttgcctaatttgccggaaaaaaaattaagttccggtttgccgttttgccggaaatattcagttcccgcaagttgctgatttggtggaaattgtcgtcttcggcaaatttccggtttccccatttgccggaaatgttaatttttgccaaattgccgatttgccggaatatataaattccggcgaattgctgatttgatgggaattatcaattttggcaatttgccggaaatgttcatttttggaaaattgcccatttaccggaaattttcatttttggaaaatttcaggtttgcccaattgcgggaaattatcgattccggcaaattgcatgtttgcccaatttgccgaaaactttcaattccggcaaattgccgatttttcgattccggcacatttcagattttccaatatgccggatatttgcaattccggcaatatgccgattttccgctttgccggaactttccaataccggcaaattgccgattttccgatatgccggaaattttcaattccggcaaattgccgatttgccggaatttttctattccggcaagttgccgattttcggaaaattttcatttttggcgatttgccggaaattttcaattccggccagttgccgatttgccagaaattataaattccggccagttgccgatttgccagaaattatgaattccggcaaatttccattttgccggaaattttcaattccggcaaatgcaggtttgcctaatttgccggaaattttcaattccggccagttgccgatttgccagaaattatgaattccggcaaatttccattttgccggaaattttctattccggcaaatttccattttgccggaaattttcaattccggcaaatgcaggtttgcctaatttgccggaaaatgttccattccggcaatctgccgatttttggcgatttgccggaaattttctgcaaatcgcatgatgattgcctaatttgccggaataattcaattccggcaaaatgccaaatgcttgccacccacctctctgtttcatactagtttatttcgaaaaaaaaatttttttctgaaataaaaaaaaatacactaaattttttgaaaattgaaatttttaattaaaaaaaactttttttttttcagaaaaccagtgaccacaatgagaactccagccgccaccccggctgctccaccaacccgtccaactccatcccgttcttcagctgctccgagagcaacagctccaactccaacagcagcacctccaaaaacttgtgcaccgcccgttcgttctgcatcaaccgtagcagcggctgctgctgctgcaccaccgggagtcgatatggcgacatttaataaattaaaagaagaactggaagaagttacacgtcagctgacagaatctgacaatgttattgcaagtctggaaaaagaaagagacttttattttagtaaacttcgaacgattgaagttatttgtcaggataatgaatcgattggaaatgttgaagttaatcgagttttggaggtaaaaattgatgaaaattgggaaaaactaccgaaagtagcctgaaatttggatcagggatgtgcggcaaatttgccgaatttgccgaatttgccgaatttgccgagctcggcaaatttcaaaaaagtagatttgccgaatttgccgcacacgtcaaaaattttacagtacaattttgactaaaactattgattttttagccaaaaatttagtaaaatgacacaaaattgacttagttttatgcttaaacagacatactacgcggaacttattcagaaaccagatgtgtgttaagaattcagtagatttggtgctccaaaaaacataaaaaatatcaaattttttcgagttttgcacggcaaatttgccgaatttgccgtttgccgagctcggcaaattttgagatttgccgcacacccctgatttggatttagaatgtttagaaaagagcaattttagagataaaattcaagaaatttaaaaaattccgaaatttttgataattgctaatttccaactatatcaaagtcaaaaaagtgagacttttttgaaaattttgattttttttaatttagaaaattctcgaaaatttgaaaaaaaattcaaattattcggaaaattgcgtatatttgtgtgaaaaataaaaaaaaataatttaaaaattccgaaaatttgaagaaagtatgtttaaaacatttttttaattgaaaaattccggaaatttcaaaaaaaaaattttgtttgaaaacatatgaaaaactatttaaagtatcaatttttagataaaattcaagaaatttcaaaaattccgaaaattccaaaatttttgataattgctcatttccaacaatatcaaaaatgaaaaaaagtgaaaattttgttgaaaatttaaatttttttttttaatttagaaaattctcggaaaattgcgtatatttgtgtgaaaaattcctaaagtgagatttttcggaaattttcatttttggcgatttgcctaatatgccggaaattatcaattccggcaaattgccgtttttccgatttgccggaaaaatttgaaacatttgggaaaaaaattgtttttgaaatttttaaaaataattatctatgtaaattaaaaaaaatatatatatatgtatataacttttttatttaaaaattccgaaaattcgaaaaaaaaacatatgtttggaaatttcaacttttttatttacaaaaaaatttaaacttcaaaaaaaatctgctttgaaaatttatgaaaaaatatttaaagtagcatatatatttgcaaaacattgaaaatttggctgaaaaaactgaaaatttaatcaattttgaaaataaaaaaatgtaaattttgaaaataaaaaaaactttcaaaatttttgataattgctaatttccaactatatcaaaagtaaaaaagtgagactttttttgaaaatttaaattttttaaatttagaaaattctcggaaatttgaaaaaaaagaacaattattcgtaaaattgcaaatatttgtgtggaaaatgtgtggaaattaaaaaaaaatttcatctaaaaattcccaaaatttgaagaaagtatgtttgaaacatttcattaattttttttataattaaattccggaaatttcaaaaaaaaaaattttgtttgaaaacatatgaaaaactatttaaagtatcatcaatttttagataaaattcaagaaatttcaaaaattccaaaatttttgataattgctaatttccaactatatcaaagtcaaaaaagtgaaaattttgttgaaaattttgaattttttttaaattcagaaactttataagaaaaacaaccaaaggtaactttttagtatattttttcattggaaattttgaagaaaattttttaaaaataaaacttctcgaaaatttgaaaaaaaaataaaattcgaaagttacgtatatttgtgtgaaaaaaacgttttttatttcaatttaaaaaattcctaaaattttgaaaaaatatcaaccgaaaaaaaacattttttttaaatgaaaattctcggaaagtagcgaaaaattccgaaagtgatgcatattcacaaaaaaaattattttttatttaataaaaaaacgtaattttgaaacatttttttgtttaaaaatgtttttttttatttacaaaaaaaattaaaattccggaaaagtctgaaattgaatattaaaaaaaaaaagaaaacagcaatttatcccttaattttgaaaaatattcaatttcgacattttactttttttaaaattagatttaaaatttctgaaaatttgcagaaaaaactgaaaaaataactaccccgaaaaaaaagttcttaaaaacatatttccaggttctctacgagacggaagaaggattcgcaccaccagaagacgaggcaaatggcggagcagaagccgaagaattctaaactatttaatattttctctattgtttaattccagctttcaagccaagcttctacccaaacacttcaattttactcccaaaaaaatatgcgattttacaatgttatatttcaccgaaaaccccctctgcttataattatagttaacttattaattttcatgaacttattcaataactgcaccaaattggccgccgcttcttcttttccacttgaaattttcagtttttcttttttcattcttccatcccaacacctatgacattgtcagtattttaattgattggctttcaattttttttcgattttaaaaatcatttcctttttttcaccgaacatttaacgcttttttctaattgttacgtcgtgcttttctttgtgctaaaataaattatgatatttaaaaaagaattttgcttccttcaaacaaaaatttcaaaaaatgatgggtctgctaaatacattttgtagtttgtagtctggcatacccacttagtaaaatcatcagtttttgctgtaattttgaacagttttcccttaaattttgcattttctcgggatttgaatgtgacaattcatgaaaatttactcaaaaaatcgatttttcgcatagaaaatattggaattttgggatttaaatttgtagtcgttgatcatattttcaaaatgctccaaacagacaaattttaagtttagagcaaaaattgattgacaaaacgatgaaaatatgcccaacgactccaaattccaatttttaaagtctttatctacactcattttttctattttcttttctgagcacaccataactggttagatgcttgggtctgctaaatatttttgtgtagtttgtagtctggcaaacccactcggtgaaaatggccaattttgctgtaattttaagaggttatcctgatttttggcgggaaaaatctcaaaatgtgcattttctcggagcatgtaattgaaaatttactcaaaaaaatcgatttttcgcttagaaaatatttgaattcggcaaaattatgcataaaatcacaatttaacccgtctgaaaacccgaaaatccacatttttcatcgattttctgttaaaaatctgcttattttcacctgaaaacacaaaatttagtcgaaaaaatgatgggtcggctaaataattttgtgtagtttgtagtctagcagaccggaaacgattatttttcgatttttcttttttttttaacccaaaagtttgggtctgctaaacattgttgtgtagtttgtagtgtggcaggcccaattgcttcaacattggactgtgtcactggaatttgagatttagaaataatttattgcgcgtagtaaaactaatcaagtgaacattttgaacgggtgaaaaagcgaataaataaaaaataaataaatatttaaaaaatgcgtgggcggtggaatgtacaaattatcgattgatgattctcaacataatccttcatcatcgtcatcttcttgtccgtcaccgagtcccgcatttccagacggtgcttttagaattttcatcactcggagatactgaaaaattgaacggtttttaggatgataattcgataaaatgagccaaacctcattgtccatagaccgtagggctccacatttcagtacattctggaaactttcatcatcgccagcctcatagaatccgataagattctcacatacacgtccatcttctgatgtttgaaaatccggagattgactgcaaaaaattgaattttcgatggaattgtttaaattttgattagaaaaaaaaaatcgatttttcaaaaacttacattttttttagagctacgaaattgttttttttgttctgattttttcgaaaaaaaaatggtctgctaaactacaatctacaaaccatttaggtctgctaattattttctgtagtttgtagtctggcagacccacaaatgggtctgccagagtacaaaaactgcaaaaatacagtttttagaattttccgtttttctaacaaaagtgcaaatttacgaaaaatcagcatttttgcaataaaaaactggacaattcggcaaaaaccggtttaaaaaaaatatttccgtgtagtttgtagtttgggtctgccagactacaaactacagaaaataattagcagacctaaatggtttgtagtttgttgtctggcagacccaaactacaaactacacggaaatattttttttaaaccggtttttgccgaattgtccagttttttattgcaaaaatgctgatttttcgtaaatttgcacttttgttagaaaaacggaaaattccaaagacccatttgtgggtctgccagactacaaactacaaaccacttgggtctgctgattatattttgtagtttgtagtctggcagacccaaatcagtttgggtctgccagactacaaactacacaacagcttcgaaaaatcgagtttcgtcgtatttttcgacttcttccgcataaatttcaatttttaataaaatttttcgcgtgtcttcgtaccaaataacccatccataatctttgagagccgccactgaatcttccagagccaaattcactataacaagaccgattccgagttggccaatacgtggatattcctgaaaatcggaaaaatttaaaaaaaatctttgtcaaaatttagaaaattcaaaattcttgtagtttgtagtctagcagaccaattttttaaataaagttgaaaaattcaaattttcgtaaaaatacacggaaaaatcagaaattgattgttttttttgtagtttgtagtctaaaaaatagcacgtcccactataaactacaaaagttcaatttttaaaaaagtgaaaaacaaaaaaaaatcaaaaatttgcaatttttcagaacatccaaaaaaattaaaaaattttgttttttttttcgttttttctatagaattttcgtgtagtttgtagtctatcagtacccgaatttcggcgaatttctcaatttcctcccgaatcgatccgagtgctcctttataatcagtcaattgtagtgataattttgtgatttgtttcaagaaattgctcgccatttttgcacgatccgattgttggaccaaagccaatccacgttggtaaatctgcaaaaaaaattgattttttatcaatcggctgtgcattttctcaggaaattttgtggaaaaaccacggaaaatcgattttttacccagaaaacttgaaaaacaccattttcagagcttttatagccaaaaaatgccgagaatccgaatatttccagttaaaaacgcaaaaaaaaaatcaaaatttagtcgaaaaatatgggtctgctaaatacattttgtagtttgtagtctggcagacccatttggtaaaaatcgtcaattttgctctaattttgagcaattttccagattttttggctggatcactctcaattatgcattttctcgaaaatttgcagaaaaaaatcaattttcacatagaaaatatgcataaaatcacatttttcgccaaaaaaaccgtctaaaaacccaaaaaaatacacattttctgtgagaaacggagttttgccctaaaaatctgctcattttcgtttgaaaactcaaaattttgtcg
Mapping_targetY59A8B
OriginSpeciesCaenorhabditis elegans
VisibleDescriptionSL1 trans-splice leader acceptor site
SO_termSO:0000706
Defined_byDefined_by_analysisRNASeq.elegans.BA671.WBls:0000041.Hermaphrodite.WBbt:0007833.PRJNA33023.SRX0081361
RemarkDefined by RNASeq data (example read: SRR023536.29207030.+.SL1 + 28M) from RNASeq.elegans.BA671.WBls:0000041.Hermaphrodite.WBbt:0007833.PRJNA33023.SRX008136 with 1 reads
MethodSL1