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WormBase Tree Display for Variation: WBVar02122165

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Name Class

WBVar02122165NamePublic_nameWBVar02122165
Other_namecewivar00853088
Sequence_detailsSMapS_parentSequenceY59A8B
Flanking_sequencesGAAGAAATGCAGTCATATTCCAGCGGCGAATCTGCATCAACCGTAGCAGCGGCTGCTGCTGCTGCACCACCGGGAGTCGATATGGCGACATTTAATAAATTAAAAGAAGAACTGGAAGAAGTTACACGTCAGCTGACAGAATCTGACAATGTTATTGCAAGTCTGGAAAAAGAAAGAGACTTTTATTTTAGTAAACTTCGAACGATTGAAGTTATTTGTCAGGATAATGAATCGATTGGAAATGTTGAAGTTAATCGAGTTTTGGAGGTAAAAATTGATGAAAATTGGGAAAAACTACCGAAAGTAGCCTGAAATTTGGATCAGGGATGTGCGGCAAATTTGCCGAATTTGCCGAATTTGCCGAATTTGCCGAGCTCGGCAAATTTCAAAAAAGTAGATTTGCCGAATTTGCCGCACACGTCAAAAATTTTACAGTACAATTTTGACTAAAACTATTGATTTTTTAGCCAAAAATTTAGTAAAATGACACAAAATTGACTTAGTTTTATGCTTAAACAGACATACTACGCGGAACTTATTCAGAAACCAGATGTGTGTTAAGAATTCAGTAGATTTGGTGCTCCAAAAAACATAAAAAATATCAAATTTTTTCGAGTTTTGCACGGCAAATTTGCCGAATTTGCCGTTTGCCGAGCTCGGCAAATTTTGAGATTTGCCGCACACCCCTGATTTGGATTTAGAATGTTTAGAAAAGAGCAATTTTAGAGATAAAATTCAAGAAATTTAAAAAATTCCGAAATTTTTGATAATTGCTAATTTCCAACTATATCAAAGTCAAAAAAGTGAGACTTTTTTGAAAATTTTGATTTTTTTTAATTTAGAAAATTCTCGAAAATTTGAAAAAAAATTCAAATTATTCGGAAAATTGCGTATATTTGTGTGAAAAATAAAAAAAAATAATTTAAAAATTCCGAAAATTTGAAGAAAGTATGTTTAAAACATTTTTTTAATTGAAAAATTCCGGAAATTTCAAAAAAAAAATTTTGTTTGAAAACATATGAAAAACTATTTAAAGTATCAATTTTTAGATAAAATTCAAGAAATTTCAAAAATTCCGAAAATTCCAAAATTTTTGATAATTGCTCATTTCCAACAATATCAAAAATGAAAAAAAGTGAAAATTTTGTTGAAAATTTAAATTTTTTTTTTTAATTTAGAAAATTCTCGGAAAATTGCGTATATTTGTGTGAAAAATTCCTAAAGTGAGATTTTTCGGAAATTTTCATTTTTGGCGATTTGCCTAATATGCCGGAAATTATCAATTCCGGCAAATTGCCGTTTTTCCGATTTGCCGGAAAAATTTGAAACATTTGGGAAAAAAATTGTTTTTGAAATTTTTAAAAATAATTATCTATGTAAATTAAAAAAAATATATATATATGTATATAACTTTTTTATTTAAAAATTCCGAAAATTCGAAAAAAAAACATATGTTTGGAAATTTCAACTTTTTTATTTACAAAAAAATTTAAACTTCAAAAAAAATCTGCTTTGAAAATTTATGAAAAAATATTTAAAGTAGCATATATATTTGCAAAACATTGAAAATTTGGCTGAAAAAACTGAAAATTTAATCAATTTTGAAAATAAAAAAATGTAAATTTTGAAAATAAAAAAAACTTTCAAAATTTTTGATAATTGCTAATTTCCAACTATATCAAAAGTAAAAAAGTGAGACTTTTTTTGAAAATTTAAATTTTTTAAATTTAGAAAATTCTCGGAAATTTGAAAAAAAAGAACAATTATTCGTAAAATTGCAAATATTTGTGTGGAAAATGTGTGGAAATTAAAAAAAAATTTCATCTAAAAATTCCCAAAATTTGAAGAAAGTATGTTTGAAACATTTCATTAATTTTTTTTATAATTAAATTCCGGAAATTTCAAAAAAAAAAATTTTGTTTGAAAACATATGAAAAACTATTTAAAGTATCATCAATTTTTAGATAAAATTCAAGAAATTTCAAAAATTCCAAAATTTTTGATAATTGCTAATTTCCAACTATATCAAAGTCAAAAAAGTGAAAATTTTGTTGAAAATTTTGAATTTTTTTTAAATTCAGAAACTTTATAAGAAAAACAACCAAAGGTAACTTTTTAGTATATTTTTTCATTGGAAATTTTGAAGAAAATTTTTTAAAAATAAAACTTCTCGAAAATTTGAAAAAAAAATAAAATTCGAAAGTTACGTATATTTGTGTGAAAAAAACGTTTTTTATTTCAATTTAAAAAATTCCTAAAATTTTGAAAAAATATCAACCGAAAAAAAACATTTTTTTTAAATGAAAATTCTCGGAAAGTAGCGAAAAATTCCGAAAGTGATGCATATTCACAAAAAAAATTATTTTTTATTTAATAAAAAAACGTAATTTTGAAACATTTTTTTGTTTAAAAATGTTTTTTTTTATTTACAAAAAAAATTAAAATTCCGGAAAAGTCTGAAATTGAATATTAAAAAAAAAAAGAAAACAGCAATTTATCCCTTAATTTTGAAAAATATTCAATTTCGACATTTTACTTTTTTTAAAATTAGATTTAAAATTTCTGAAAATTTGCAGAAAAAACTGAAAAAATAACTACCCCGAAAAAAAAGTTCTTAAAAACATATTTCCAGGTTCTCTACGAGACGGAAGAAGGATTCGCACCACCAGAAGACGAGGCAAATGGCGGAGCAGAAGCCGAAGAATTCTAAACTATTTAATATTTTCTCTATTGTTTAATTCCAGCTTTCAAGCCAAGCTTCTACCCAAACACTTCAATTTTACTCCCAAAAAAATATGCGATTTTACAATGTTATATTTCACCGAAAACCCCCTCTGCTTATAATTATAGTTAACTTATTAATTTTCATGAACTTATTCAATAACTGCACCAAATTGGCCGCCGCTTCTTCTTTTCCACTTGAAATTTTCAGTTTTTCTTTTTTCATTCTTCCATCCCAACACCTATGACATTGTCAGTATTTTAATTGATTGGCTTTCAATTTTTTTTCGATTTTAAAAATCATTTCCTTTTTTTCACCGAACATTTAACGCTTTTTTCTAATTGTTACGTCGTGCTTTTCTTTGTGCTAAAATAAATTATGATATTTAAAAAAGAATTTTGCTTCCTTCAAACAAAAATTTCAAAAAATGATGGGTCTGCTAAATACATTTTGTAGTTTGTAGTCTGGCATACCCACTTAGTAAAATCATCAGTTTTTGCTGTAATTTTGAACAGTTTTCCCTTAAATTTTGCATTTTCTCGGGATTTGAATGTGACAATTCATGAAAATTTACTCAAAAAATCGATTTTTCGCATAGAAAATATTGGAATTTTGGGATTTAAATTTGTAGTCGTTGATCATATTTTCAAAATGCTCCAAACAGACAAATTTTAAGTTTAGAGCAAAAATTGATTGACAAAACGATGAAAATATGCCCAACGACTCCAAATTCCAATTTTTAAAGTCTTTATCTACACTCATTTTTTCTATTTTCTTTTCTGAGCACACCATAACTGGTTAGATGCTTGGGTCTGCTAAATATTTTTGTGTAGTTTGTAGTCTGGCAAACCCACTCGGTGAAAATGGCCAATTTTGCTGTAATTTTAAGAGGTTATCCTGATTTTTGGCGGGAAAAATCTCAAAATGTGCATTTTCTCGGAGCATGTAATTGAAAATTTACTCAAAAAAATCGATTTTTCGCTTAGAAAATATTTGAATTCGGCAAAATTATGCATAAAATCACAATTTAACCCGTCTGAAAACCCGAAAATCCACATTTTTCATCGATTTTCTGTTAAAAATCTGCTTATTTTCACCTGAAAACACAAAATTTAGTCGAAAAAATGATGGGTCGGCTAAATAATTTTGTGTAGTTTGTAGTCTAGCAGACCGGAAACGATTATTTTTCGATTTTTCTTTTTTTTTTAACCCAAAAGTTTGGGTCTGCTAAACATTGTTGTGTAGTTTGTAGTGTGGCAGGCCCAATTGCTTCAACATTGGACTGTGTCACTGGAATTTGAGATTTAGAAATAATTTATTGCGCGTAGTAAAACTAATCAAGTGAACATTTTGAACGGGTGAAAAAGCGAATAAATAAAAAATAAATAAATATTTAAAAAATGCGTGGGCGGTGGAATGTACAAATTATCGATTGATGATTCTCAACATAATCCTTCATCATCGTCATCTTCTTGTCCGTCACCGAGTCCCGCATTTCCAGACGGTGCTTTTAGAATTTTCATCACTCGGAGATACTGAAAAATTGAACGGTTTTTAGGATGATAATTCGATAAAATGAGCCAAACCTCATTGTCCATAGACCGTAGGGCTCCACATTTCAGTACATTCTGGAAACTTTCATCATCGCCAGCCTCATAGAATCCGATAAGATTCTCACATACACGTCCATCTTCTGATGTTTGAAAATCCGGAGATTGACTGCAAAAAATTGAATTTTCGATGGAATTGTTTAAATTTTGATTAGAAAAAAAAAATCGATTTTTCAAAAACTTACATTTTTTTTAGAGCTACGAAATTGTTTTTTTTGTTCTGATTTTTTCGAAAAAAAAATGGTCTGCTAAACTACAATCTACAAACCATTTAGGTCTGCTAATTATTTTCTGTAGTTTGTAGTCTGGCAGACCCACAAATGGGTCTGCCAGAGTACAAAAACTGCAAAAATACAGTTTTTAGAATTTTCCGTTTTTCTAACAAAAGTGCAAATTTACGAAAAATCAGCATTTTTGCAATAAAAAACTGGACAATTCGGCAAAAACCGGTTTAAAAAAAATATTTCCGTGTAGTTTGTAGTTTGGGTCTGCCAGACTACAAACTACAGAAAATAATTAGCAGACCTAAATGGTTTGTAGTTTGTTGTCTGGCAGACCCAAACTACAAACTACACGGAAATATTTTTTTTAAACCGGTTTTTGCCGAATTGTCCAGTTTTTTATTGCAAAAATGCTGATTTTTCGTAAATTTGCACTTTTGTTAGAAAAACGGAAAATTCCAAAGACCCATTTGTGGGTCTGCCAGACTACAAACTACAAACCACTTGGGTCTGCTGATTATATTTTGTAGTTTGTAGTCTGGCAGACCCAAATCAGTTTGGGTCTGCCAGACTACAAACTACACAACAGCTTCGAAAAATCGAGTTTCGTCGTATTTTTCGACTTCTTCCGCATAAATTTCAATTTTTAATAAAATTTTTCGCGTGTCTTCGTACCAAATAACCCATCCATAATCTTTGAGAGCCGCCACTGAATCTTCCAGAGCCAAATTCACTATAACAAGACCGATTCCGAGTTGGCCAATACGTGGATATTCCTGAAAATCGGAAAAATTTAAAAAAAATCTTTGTCAAAATTTAGAAAATTCAAAATTCTTGTAGTTTGTAGTCTAGCAGACCAATTTTTTAAATAAAGTTGAAAAATTCAAATTTTCGTAAAAATACACGGAAAAATCAGAAATTGATTGTTTTTTTTGTAGTTTGTAGTCTAAAAAATAGCACGTCCCACTATAAACTACAAAAGTTCAATTTTTAAAAAAGTGAAAAACAAAAAAAAATCAAAAATTTGCAATTTTTCAGAACATCCAAAAAAATTAAAAAATTTTGTTTTTTTTTTCGTTTTTTCTATAGAATTTTCGTGTAGTTTGTAGTCTATCAGTACCCGAATTTCGGCGAATTTCTCAATTTCCTCCCGAATCGATCCGAGTGCTCCTTTATAATCAGTCAATTGTAGTGATAATTTTGTGATTTGTTTCAAGAAATTGCTCGCCATTTTTGCACGATCCGATTGTTGGACCAAAGCCAATCCACGTTGGTAAATCTGCAAAAAAAATTGATTTTTTATCAATCGGCTGTGCATTTTCTCAGGAAATTTTGTGGAAAAACCACGGAAAATCGATTTTTTACCCAGAAAACTTGAAAAACACCATTTTCAGAGCTTTTATAGCCAAAAAATGCCGAGAATCCGAATATTTCCAGTTAAAAACGCAAAAAAAAAATCAAAATTTAGTCGAAAAATATGGGTCTGCTAAATACATTTTGTAGTTTGTAGTCTGGCAGACCCATTTGGTAAAAATCGTCAATTTTGCTCTAATTTTGAGCAATTTTCCAGATTTTTTGGCTGGATCACTCTCAATTATGCATTTTCTCGAAAATTTGCAGAAAAAAATCAATTTTCACATAGAAAATATGCATAAAATCACATTTTTCGCCAAAAAAACCGTCTAAAAACCCAAAAAAATACACATTTTCTGTGAGAAACGGAGTTTTGCCCTAAAAATCTGCTCATTTTCGTTTGAAAACTCAAAATTTTGTCGAAAAATGATGGG
Mapping_targetCHROMOSOME_V
Source_location225CHROMOSOME_V1803900118058000From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
Type_of_mutationDeletion
SeqStatusSequenced
Variation_typeNatural_variant
OriginSpeciesCaenorhabditis elegans
StrainWBStrain00006640From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
WBStrain00022886From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
WBStrain00022899From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
WBStrain00027652From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
LaboratoryVC
AnalysisMillion_mutation_project_reanalysis
StatusLive
AffectsGeneWBGene00007062
WBGene00013343
WBGene00013344
WBGene00305845
WBGene00305846
WBGene00197676
WBGene00200466
WBGene00305847
WBGene00044794
TranscriptY59A8B.29
Y59A8B.25.1
Y59A8B.45
Y59A8B.7.1
Y59A8B.33
Y59A8B.6.1
Y59A8B.46
Y59A8B.9.1
Y59A8B.44
RemarkThe boundaries of this variant have been identified only approximately
This allele is a copy number variation determined from whole-genome sequence data, and should be assumed to be non-homozygous
MethodWGS_Flibotte