Questions, Feedback & Help
Send us an email and we'll get back to you ASAP. Or you can read our Frequently Asked Questions.

WormBase Tree Display for Variation: WBVar02121804

expand all nodes | collapse all nodes | view schema

Name Class

WBVar02121804NamePublic_nameWBVar02121804
Other_namecewivar00852727
Sequence_detailsSMapS_parentSequenceY59A8B
Flanking_sequencesAAAGCTGATAAATAAATATTTTTTGCAGATGCTAAAACAATTTCCAAGTAAAAAAATCATGTATTCAGTGGGCAAGCAGCGGTGAAAGTGGTCAATGCAATATGATGGATTCTGCATCAACCGTAGCAGCGGCTGCTGCTGCTGCACCACCGGGAGTCGATATGGCGACATTTAATAAATTAAAAGAAGAACTGGAAGAAGTTACACGTCAGCTGACAGAATCTGACAATGTTATTGCAAGTCTGGAAAAAGAAAGAGACTTTTATTTTAGTAAACTTCGAACGATTGAAGTTATTTGTCAGGATAATGAATCGATTGGAAATGTTGAAGTTAATCGAGTTTTGGAGGTAAAAATTGATGAAAATTGGGAAAAACTACCGAAAGTAGCCTGAAATTTGGATCAGGGATGTGCGGCAAATTTGCCGAATTTGCCGAATTTGCCGAATTTGCCGAGCTCGGCAAATTTCAAAAAAGTAGATTTGCCGAATTTGCCGCACACGTCAAAAATTTTACAGTACAATTTTGACTAAAACTATTGATTTTTTAGCCAAAAATTTAGTAAAATGACACAAAATTGACTTAGTTTTATGCTTAAACAGACATACTACGCGGAACTTATTCAGAAACCAGATGTGTGTTAAGAATTCAGTAGATTTGGTGCTCCAAAAAACATAAAAAATATCAAATTTTTTCGAGTTTTGCACGGCAAATTTGCCGAATTTGCCGTTTGCCGAGCTCGGCAAATTTTGAGATTTGCCGCACACCCCTGATTTGGATTTAGAATGTTTAGAAAAGAGCAATTTTAGAGATAAAATTCAAGAAATTTAAAAAATTCCGAAATTTTTGATAATTGCTAATTTCCAACTATATCAAAGTCAAAAAAGTGAGACTTTTTTGAAAATTTTGATTTTTTTTAATTTAGAAAATTCTCGAAAATTTGAAAAAAAATTCAAATTATTCGGAAAATTGCGTATATTTGTGTGAAAAATAAAAAAAAATAATTTAAAAATTCCGAAAATTTGAAGAAAGTATGTTTAAAACATTTTTTTAATTGAAAAATTCCGGAAATTTCAAAAAAAAAATTTTGTTTGAAAACATATGAAAAACTATTTAAAGTATCAATTTTTAGATAAAATTCAAGAAATTTCAAAAATTCCGAAAATTCCAAAATTTTTGATAATTGCTCATTTCCAACAATATCAAAAATGAAAAAAAGTGAAAATTTTGTTGAAAATTTAAATTTTTTTTTTTAATTTAGAAAATTCTCGGAAAATTGCGTATATTTGTGTGAAAAATTCCTAAAGTGAGATTTTTCGGAAATTTTCATTTTTGGCGATTTGCCTAATATGCCGGAAATTATCAATTCCGGCAAATTGCCGTTTTTCCGATTTGCCGGAAAAATTTGAAACATTTGGGAAAAAAATTGTTTTTGAAATTTTTAAAAATAATTATCTATGTAAATTAAAAAAAATATATATATATGTATATAACTTTTTTATTTAAAAATTCCGAAAATTCGAAAAAAAAACATATGTTTGGAAATTTCAACTTTTTTATTTACAAAAAAATTTAAACTTCAAAAAAAATCTGCTTTGAAAATTTATGAAAAAATATTTAAAGTAGCATATATATTTGCAAAACATTGAAAATTTGGCTGAAAAAACTGAAAATTTAATCAATTTTGAAAATAAAAAAATGTAAATTTTGAAAATAAAAAAAACTTTCAAAATTTTTGATAATTGCTAATTTCCAACTATATCAAAAGTAAAAAAGTGAGACTTTTTTTGAAAATTTAAATTTTTTAAATTTAGAAAATTCTCGGAAATTTGAAAAAAAAGAACAATTATTCGTAAAATTGCAAATATTTGTGTGGAAAATGTGTGGAAATTAAAAAAAAATTTCATCTAAAAATTCCCAAAATTTGAAGAAAGTATGTTTGAAACATTTCATTAATTTTTTTTATAATTAAATTCCGGAAATTTCAAAAAAAAAAATTTTGTTTGAAAACATATGAAAAACTATTTAAAGTATCATCAATTTTTAGATAAAATTCAAGAAATTTCAAAAATTCCAAAATTTTTGATAATTGCTAATTTCCAACTATATCAAAGTCAAAAAAGTGAAAATTTTGTTGAAAATTTTGAATTTTTTTTAAATTCAGAAACTTTATAAGAAAAACAACCAAAGGTAACTTTTTAGTATATTTTTTCATTGGAAATTTTGAAGAAAATTTTTTAAAAATAAAACTTCTCGAAAATTTGAAAAAAAAATAAAATTCGAAAGTTACGTATATTTGTGTGAAAAAAACGTTTTTTATTTCAATTTAAAAAATTCCTAAAATTTTGAAAAAATATCAACCGAAAAAAAACATTTTTTTTAAATGAAAATTCTCGGAAAGTAGCGAAAAATTCCGAAAGTGATGCATATTCACAAAAAAAATTATTTTTTATTTAATAAAAAAACGTAATTTTGAAACATTTTTTTGTTTAAAAATGTTTTTTTTTATTTACAAAAAAAATTAAAATTCCGGAAAAGTCTGAAATTGAATATTAAAAAAAAAAAGAAAACAGCAATTTATCCCTTAATTTTGAAAAATATTCAATTTCGACATTTTACTTTTTTTAAAATTAGATTTAAAATTTCTGAAAATTTGCAGAAAAAACTGAAAAAATAACTACCCCGAAAAAAAAGTTCTTAAAAACATATTTCCAGGTTCTCTACGAGACGGAAGAAGGATTCGCACCACCAGAAGACGAGGCAAATGGCGGAGCAGAAGCCGAAGAATTCTAAACTATTTAATATTTTCTCTATTGTTTAATTCCAGCTTTCAAGCCAAGCTTCTACCCAAACACTTCAATTTTACTCCCAAAAAAATATGCGATTTTACAATGTTATATTTCACCGAAAACCCCCTCTGCTTATAATTATAGTTAACTTATTAATTTTCATGAACTTATTCAATAACTGCACCAAATTGGCCGCCGCTTCTTCTTTTCCACTTGAAATTTTCAGTTTTTCTTTTTTCATTCTTCCATCCCAACACCTATGACATTGTCAGTATTTTAATTGATTGGCTTTCAATTTTTTTTCGATTTTAAAAATCATTTCCTTTTTTTCACCGAACATTTAACGCTTTTTTCTAATTGTTACGTCGTGCTTTTCTTTGTGCTAAAATAAATTATGATATTTAAAAAAGAATTTTGCTTCCTTCAAACAAAAATTTCAAAAAATGATGGGTCTGCTAAATACATTTTGTAGTTTGTAGTCTGGCATACCCACTTAGTAAAATCATCAGTTTTTGCTGTAATTTTGAACAGTTTTCCCTTAAATTTTGCATTTTCTCGGGATTTGAATGTGACAATTCATGAAAATTTACTCAAAAAATCGATTTTTCGCATAGAAAATATTGGAATTTTGGGATTTAAATTTGTAGTCGTTGATCATATTTTCAAAATGCTCCAAACAGACAAATTTTAAGTTTAGAGCAAAAATTGATTGACAAAACGATGAAAATATGCCCAACGACTCCAAATTCCAATTTTTAAAGTCTTTATCTACACTCATTTTTTCTATTTTCTTTTCTGAGCACACCATAACTGGTTAGATGCTTGGGTCTGCTAAATATTTTTGTGTAGTTTGTAGTCTGGCAAACCCACTCGGTGAAAATGGCCAATTTTGCTGTAATTTTAAGAGGTTATCCTGATTTTTGGCGGGAAAAATCTCAAAATGTGCATTTTCTCGGAGCATGTAATTGAAAATTTACTCAAAAAAATCGATTTTTCGCTTAGAAAATATTTGAATTCGGCAAAATTATGCATAAAATCACAATTTAACCCGTCTGAAAACCCGAAAATCCACATTTTTCATCGATTTTCTGTTAAAAATCTGCTTATTTTCACCTGAAAACACAAAATTTAGTCGAAAAAATGATGGGTCGGCTAAATAATTTTGTGTAGTTTGTAGTCTAGCAGACCGGAAACGATTATTTTTCGATTTTTCTTTTTTTTTTAACCCAAAAGTTTGGGTCTGCTAAACATTGTTGTGTAGTTTGTAGTGTGGCAGGCCCAATTGCTTCAACATTGGACTGTGTCACTGGAATTTGAGATTTAGAAATAATTTATTGCGCGTAGTAAAACTAATCAAGTGAACATTTTGAACGGGTGAAAAAGCGAATAAATAAAAAATAAATAAATATTTAAAAAATGCGTGGGCGGTGGAATGTACAAATTATCGATTGATGATTCTCAACATAATCCTTCATCATCGTCATCTTCTTGTCCGTCACCGAGTCCCGCATTTCCAGACGGTGCTTTTAGAATTTTCATCACTCGGAGATACTGAAAAATTGAACGGTTTTTAGGATGATAATTCGATAAAATGAGCCAAACCTCATTGTCCATAGACCGTAGGGCTCCACATTTCAGTACATTCTGGAAACTTTCATCATCGCCAGCCTCATAGAATCCGATAAGATTCTCACATACACGTCCATCTTCTGATGTTTGAAAATCCGGAGATTGACTGCAAAAAATTGAATTTTCGATGGAATTGTTTAAATTTTGATTAGAAAAAAAAAATCGATTTTTCAAAAACTTACATTTTTTTTAGAGCTACGAAATTGTTTTTTTTGTTCTGATTTTTTCGAAAAAAAAATGGTCTGCTAAACTACAATCTACAAACCATTTAGGTCTGCTAATTATTTTCTGTAGTTTGTAGTCTGGCAGACCCACAAATGGGTCTGCCAGAGTACAAAAACTGCAAAAATACAGTTTTTAGAATTTTCCGTTTTTCTAACAAAAGTGCAAATTTACGAAAAATCAGCATTTTTGCAATAAAAAACTGGACAATTCGGCAAAAACCGGTTTAAAAAAAATATTTCCGTGTAGTTTGTAGTTTGGGTCTGCCAGACTACAAACTACAGAAAATAATTAGCAGACCTAAATGGTTTGTAGTTTGTTGTCTGGCAGACCCAAACTACAAACTACACGGAAATATTTTTTTTAAACCGGTTTTTGCCGAATTGTCCAGTTTTTTATTGCAAAAATGCTGATTTTTCGTAAATTTGCACTTTTGTTAGAAAAACGGAAAATTCCAAAGACCCATTTGTGGGTCTGCCAGACTACAAACTACAAACCACTTGGGTCTGCTGATTATATTTTGTAGTTTGTAGTCTGGCAGACCCAAATCAGTTTGGGTCTGCCAGACTACAAACTACACAACAGCTTCGAAAAATCGAGTTTCGTCGTATTTTTCGACTTCTTCCGCATAAATTTCAATTTTTAATAAAATTTTTCGCGTGTCTTCGTACCAAATAACCCATCCATAATCTTTGAGAGCCGCCACTGAATCTTCCAGAGCCAAATTCACTATAACAAGACCGATTCCGAGTTGGCCAATACGTGGATATTCCTGAAAATCGGAAAAATTTAAAAAAAATCTTTGTCAAAATTTAGAAAATTCAAAATTCTTGTAGTTTGTAGTCTAGCAGACCAATTTTTTAAATAAAGTTGAAAAATTCAAATTTTCGTAAAAATACACGGAAAAATCAGAAATTGATTGTTTTTTTTGTAGTTTGTAGTCTAAAAAATAGCACGTCCCACTATAAACTACAAAAGTTCAATTTTTAAAAAAGTGAAAAACAAAAAAAAATCAAAAATTTGCAATTTTTCAGAACATCCAAAAAAATTAAAAAATTTTGTTTTTTTTTTCGTTTTTTCTATAGAATTTTCGTGTAGTTTGTAGTCTATCAGTACCCGAATTTCGGCGAATTTCTCAATTTCCTCCCGAATCGATCCGAGTGCTCCTTTATAATCAGTCAATTGTAGTGATAATTTTGTGATTTGTTTCAAGAAATTGCTCGCCATTTTTGCACGATCCGATTGTTGGACCAAAGCCAATCCACGTTGGTAAATCTGCAAAAAAAATTGATTTTTTATCAATCGGCTGTGCATTTTCTCAGGAAATTTTGTGGAAAAACCACGGAAAATCGATTTTTTACCCAGAAAACTTGAAAAACACCATTTTCAGAGCTTTTATAGCCAAAAAATGCCGAGAATCCGAATATTTCCAGTTAAAAACGCAAAAAAAAAATCAAAATTTAGTCGAAAAATATGGGTCTGCTAAATACATTTTGTAGTTTGTAGTCTGGCAGACCCATTTGGTAAAAATCGTCAATTTTGCTCTAATTTTGAGCAATTTTCCAGATTTTTTGGCTGGATCACTCTCAATTATGCATTTTCTCGAAAATTTGCAGAAAAAAATCAATTTTCACATAGAAAATATGCATAAAATCACATTTTTCGCCAAAAAAACCGTCTAAAAACCCAAAAAAATACACATTTTCTGTGAGAAACGGAGTTTTGCCCTAAAAATCTGCTCATTTTCGTTTGAAAACTCAAAATTTTGTCGAAAAATGATGGG
Mapping_targetCHROMOSOME_V
Source_location225CHROMOSOME_V1804400118058000From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
Type_of_mutationDeletion
SeqStatusSequenced
Variation_typeNatural_variant
OriginSpeciesCaenorhabditis elegans
StrainWBStrain00006629From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
WBStrain00008273From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
WBStrain00022887From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
WBStrain00024204From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
LaboratoryVC
AnalysisMillion_mutation_project_reanalysis
StatusLive
AffectsGeneWBGene00007062
WBGene00305846
WBGene00305847
WBGene00044794
WBGene00013344
WBGene00305845
TranscriptY59A8B.9.1
Y59A8B.25.1
Y59A8B.45
Y59A8B.7.1
Y59A8B.44
Y59A8B.46
RemarkThe boundaries of this variant have been identified only approximately
This allele is a copy number variation determined from whole-genome sequence data, and should be assumed to be non-homozygous
MethodWGS_Flibotte