WormBase Tree Display for Variation: WBVar00143398
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WBVar00143398 | Evidence | Paper_evidence | WBPaper00005927 | ||||||
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Name | Public_name | e678 | |||||||
Sequence_details | Type_of_mutation | Deletion | |||||||
SeqStatus | Pending_curation | ||||||||
Variation_type | Allele | ||||||||
Origin | Species | Caenorhabditis elegans | |||||||
Strain (225) | |||||||||
Laboratory | CB | ||||||||
LW | |||||||||
Status | Live | ||||||||
Affects | Gene | WBGene00003056 | |||||||
Interactor | WBInteraction000521785 | ||||||||
WBInteraction000521941 | |||||||||
WBInteraction000524031 | |||||||||
WBInteraction000537302 | |||||||||
Genetics | Mapping_data | In_2_point (46) | |||||||
In_multi_point | 164 | ||||||||
165 | |||||||||
166 | |||||||||
167 | |||||||||
168 | |||||||||
169 | |||||||||
170 | |||||||||
171 | |||||||||
173 | |||||||||
177 | |||||||||
230 | |||||||||
277 | |||||||||
278 | |||||||||
280 | |||||||||
281 | |||||||||
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357 | |||||||||
358 | |||||||||
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393 | |||||||||
395 | |||||||||
410 | |||||||||
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532 | |||||||||
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535 | |||||||||
536 | |||||||||
551 | |||||||||
552 | |||||||||
582 | |||||||||
587 | |||||||||
612 | |||||||||
618 | |||||||||
619 | |||||||||
644 | |||||||||
645 | |||||||||
646 | |||||||||
731 | |||||||||
732 | |||||||||
789 | |||||||||
793 | |||||||||
794 | |||||||||
880 | |||||||||
916 | |||||||||
1194 | |||||||||
1207 | |||||||||
1208 | |||||||||
1212 | |||||||||
1213 | |||||||||
1319 | |||||||||
1320 | |||||||||
1321 | |||||||||
1322 | |||||||||
1328 | |||||||||
1339 | |||||||||
1342 | |||||||||
1346 | |||||||||
1353 | |||||||||
1369 | |||||||||
1387 | |||||||||
1540 | |||||||||
1546 | |||||||||
1547 | |||||||||
1550 | |||||||||
1551 | |||||||||
1588 | |||||||||
1739 | |||||||||
2005 | |||||||||
2087 | |||||||||
2171 | |||||||||
2227 | |||||||||
2228 | |||||||||
2229 | |||||||||
2230 | |||||||||
2231 | |||||||||
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2233 | |||||||||
2234 | |||||||||
2289 | |||||||||
2290 | |||||||||
2291 | |||||||||
2292 | |||||||||
2428 | |||||||||
2441 | |||||||||
2442 | |||||||||
2453 | |||||||||
2461 | |||||||||
3243 | |||||||||
3272 | |||||||||
3293 | |||||||||
3322 | |||||||||
3323 | |||||||||
3378 | |||||||||
3516 | |||||||||
4784 | |||||||||
4794 | |||||||||
4795 | |||||||||
5465 | |||||||||
5472 | |||||||||
In_pos_neg_data (19) | |||||||||
Marked_rearrangement | szT1[lon-2(e678) unc-29(e403)] | ||||||||
szT1[lon-2(e678)] | |||||||||
Description | Phenotype (24) | ||||||||
Phenotype_not_observed | WBPhenotype:0000505 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||||
Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
Remark | Males are not Ram. | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||||
Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
EQ_annotations | Anatomy_term | WBbt:0006941 | PATO:0000460 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||
Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
Life_stage | WBls:0000056 | PATO:0000460 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | |||||
Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
Phenotype_assay | Temperature | 20C | Paper_evidence | WBPaper00001328 | |||||
Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
Genotype | him-5(e1490) | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||||
Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
WBPhenotype:0001652 | Paper_evidence | WBPaper00032446 | |||||||
Curator_confirmed | WBPerson2021 | ||||||||
WBPhenotype:0001767 | Paper_evidence | WBPaper00032413 | |||||||
Curator_confirmed | WBPerson2021 | ||||||||
Remark | No significant defects in embryonic DA/DB motor neuron left/right projection patterns (Figure S1A). | Paper_evidence | WBPaper00032413 | ||||||
Curator_confirmed | WBPerson2021 | ||||||||
Variation_effect | Null | Paper_evidence | WBPaper00032413 | ||||||
Curator_confirmed | WBPerson2021 | ||||||||
Reference (33) | |||||||||
Remark | e678 is a ~9 kb deletion | ||||||||
Variation stub/paper connection generated from the May 2021 NN VFP dataset. | |||||||||
Created by WBPerson51134 from the NN_VFP_triage_pipeline | |||||||||
Method | Deletion_allele |