WormBase Tree Display for Variation: WBVar00143398
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WBVar00143398 | Evidence | Paper_evidence | WBPaper00005927 | |||||
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Name | Public_name | e678 | ||||||
Sequence_details | Type_of_mutation | Deletion | ||||||
SeqStatus | Pending_curation | |||||||
Variation_type | Allele | |||||||
Origin | Species | Caenorhabditis elegans | ||||||
Strain (225) | ||||||||
Laboratory | CB | |||||||
LW | ||||||||
Status | Live | |||||||
Affects | Gene | WBGene00003056 | ||||||
Interactor (4) | ||||||||
Genetics | Mapping_data | In_2_point (46) | ||||||
In_multi_point | 164 | |||||||
165 | ||||||||
166 | ||||||||
167 | ||||||||
168 | ||||||||
169 | ||||||||
170 | ||||||||
171 | ||||||||
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177 | ||||||||
230 | ||||||||
277 | ||||||||
278 | ||||||||
280 | ||||||||
281 | ||||||||
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357 | ||||||||
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393 | ||||||||
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410 | ||||||||
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582 | ||||||||
587 | ||||||||
612 | ||||||||
618 | ||||||||
619 | ||||||||
644 | ||||||||
645 | ||||||||
646 | ||||||||
731 | ||||||||
732 | ||||||||
789 | ||||||||
793 | ||||||||
794 | ||||||||
880 | ||||||||
916 | ||||||||
1194 | ||||||||
1207 | ||||||||
1208 | ||||||||
1212 | ||||||||
1213 | ||||||||
1319 | ||||||||
1320 | ||||||||
1321 | ||||||||
1322 | ||||||||
1328 | ||||||||
1339 | ||||||||
1342 | ||||||||
1346 | ||||||||
1353 | ||||||||
1369 | ||||||||
1387 | ||||||||
1540 | ||||||||
1546 | ||||||||
1547 | ||||||||
1550 | ||||||||
1551 | ||||||||
1588 | ||||||||
1739 | ||||||||
2005 | ||||||||
2087 | ||||||||
2171 | ||||||||
2227 | ||||||||
2228 | ||||||||
2229 | ||||||||
2230 | ||||||||
2231 | ||||||||
2232 | ||||||||
2233 | ||||||||
2234 | ||||||||
2289 | ||||||||
2290 | ||||||||
2291 | ||||||||
2292 | ||||||||
2428 | ||||||||
2441 | ||||||||
2442 | ||||||||
2453 | ||||||||
2461 | ||||||||
3243 | ||||||||
3272 | ||||||||
3293 | ||||||||
3322 | ||||||||
3323 | ||||||||
3378 | ||||||||
3516 | ||||||||
4784 | ||||||||
4794 | ||||||||
4795 | ||||||||
5465 | ||||||||
5472 | ||||||||
In_pos_neg_data (19) | ||||||||
Marked_rearrangement | szT1[lon-2(e678) unc-29(e403)] | |||||||
szT1[lon-2(e678)] | ||||||||
Description | Phenotype (24) | |||||||
Phenotype_not_observed | WBPhenotype:0000505 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | |||||
Curator_confirmed | WBPerson712 | |||||||
Remark | Males are not Ram. | Paper_evidence | WBPaper00001328 | |||||
Curator_confirmed | WBPerson712 | |||||||
EQ_annotations (2) | ||||||||
Phenotype_assay | Temperature | 20C | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||
Curator_confirmed | WBPerson712 | |||||||
Genotype | him-5(e1490) | Paper_evidence | WBPaper00001328 | |||||
Curator_confirmed | WBPerson712 | |||||||
WBPhenotype:0001652 | Paper_evidence | WBPaper00032446 | ||||||
Curator_confirmed | WBPerson2021 | |||||||
WBPhenotype:0001767 | Paper_evidence | WBPaper00032413 | ||||||
Curator_confirmed | WBPerson2021 | |||||||
Remark | No significant defects in embryonic DA/DB motor neuron left/right projection patterns (Figure S1A). | Paper_evidence | WBPaper00032413 | |||||
Curator_confirmed | WBPerson2021 | |||||||
Variation_effect | Null | Paper_evidence | WBPaper00032413 | |||||
Curator_confirmed | WBPerson2021 | |||||||
Reference (33) | ||||||||
Remark | e678 is a ~9 kb deletion | |||||||
Variation stub/paper connection generated from the May 2021 NN VFP dataset. | ||||||||
Created by WBPerson51134 from the NN_VFP_triage_pipeline | ||||||||
Method | Deletion_allele |