WormBase Tree Display for Gene: WBGene00013219
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| WBGene00013219 | SMap | S_parent | Sequence | Y54G11A | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identity | Version | 2 | |||||||
| Name | CGC_name | elof-1 | |||||||
| Sequence_name | Y54G11A.11 | ||||||||
| Molecular_name | Y54G11A.11 | ||||||||
| Y54G11A.11.1 | |||||||||
| CE22483 | |||||||||
| Y54G11A.11.2 | |||||||||
| Other_name | CELE_Y54G11A.11 | Accession_evidence | NDB | BX284602 | |||||
| Public_name | elof-1 | ||||||||
| DB_info | Database | AceView | gene | 2O637 | |||||
| WormQTL | gene | WBGene00013219 | |||||||
| WormFlux | gene | WBGene00013219 | |||||||
| NDB | locus_tag | CELE_Y54G11A.11 | |||||||
| Panther | gene | CAEEL|WormBase=WBGene00013219|UniProtKB=Q9XVZ8 | |||||||
| family | PTHR20934 | ||||||||
| NCBI | gene | 175090 | |||||||
| RefSeq | protein | NM_064582.10 | |||||||
| SwissProt | UniProtAcc | Q9XVZ8 | |||||||
| TREEFAM | TREEFAM_ID | TF313731 | |||||||
| UniProt_GCRP | UniProtAcc | Q9XVZ8 | |||||||
| Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
| History | Version_change | 1 | 26 May 2004 16:54:54 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from CDS class of WS125 | ||
| 2 | 01 Jun 2020 11:44:25 | WBPerson1983 | Name_change | CGC_name | elof-1 | ||||
| Status | Live | ||||||||
| Gene_info | Biotype | SO:0001217 | |||||||
| Gene_class | elof | ||||||||
| Allele (23) | |||||||||
| Possibly_affected_by | WBVar02154114 | ||||||||
| Strain | WBStrain00049418 | ||||||||
| RNASeq_FPKM (74) | |||||||||
| GO_annotation | 00102952 | ||||||||
| 00102953 | |||||||||
| 00102954 | |||||||||
| 00102955 | |||||||||
| 00102956 | |||||||||
| 00102957 | |||||||||
| 00102958 | |||||||||
| 00102959 | |||||||||
| 00102960 | |||||||||
| Ortholog (35) | |||||||||
| Structured_description | Automated_description | Predicted to enable RNA polymerase II complex binding activity. Predicted to be involved in transcription elongation by RNA polymerase II. Located in nucleolus. Is an ortholog of human ELOF1 (elongation factor 1). | Paper_evidence | WBPaper00065943 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson324 | ||||||||
| WBPerson37462 | |||||||||
| Inferred_automatically | This description was generated automatically by a script based on data from the WS291 version of WormBase | ||||||||
| Date_last_updated | 29 Nov 2023 00:00:00 | ||||||||
| Molecular_info | Corresponding_CDS | Y54G11A.11 | |||||||
| Corresponding_transcript | Y54G11A.11.1 | ||||||||
| Y54G11A.11.2 | |||||||||
| Other_sequence | EY463060.1 | ||||||||
| NB10291 | |||||||||
| MC01154 | |||||||||
| CR07517 | |||||||||
| CRC07443_1 | |||||||||
| OOC03494_1 | |||||||||
| AYC01742_1 | |||||||||
| AE03391 | |||||||||
| JK314912.1 | |||||||||
| Name_isotig06335 | |||||||||
| MPC00587_1 | |||||||||
| GO249332.1 | |||||||||
| HCC02355_1 | |||||||||
| CBC01288_1 | |||||||||
| Tcir_isotig05113 | |||||||||
| HG01711 | |||||||||
| ES742789.1 | |||||||||
| CR00993 | |||||||||
| Tcol_isotig19967 | |||||||||
| Dviv_isotig01113 | |||||||||
| JI171045.1 | |||||||||
| NBC01956_1 | |||||||||
| MJ04335 | |||||||||
| ASC37445_1 | |||||||||
| MH10273 | |||||||||
| HGC02486_1 | |||||||||
| MCC00010_1 | |||||||||
| Tcir_isotig05112 | |||||||||
| ACC35983_1 | |||||||||
| GP00057 | |||||||||
| Acan_isotig14974 | |||||||||
| CN477867.1 | |||||||||
| Name_isotig04637 | |||||||||
| HG06110 | |||||||||
| PPC03518_1 | |||||||||
| ES739939.1 | |||||||||
| Dviv_isotig01112 | |||||||||
| FE913265.1 | |||||||||
| MHC08330_1 | |||||||||
| GPC02151_1 | |||||||||
| NBC01480_1 | |||||||||
| NB07224 | |||||||||
| HG02460 | |||||||||
| ES741112.1 | |||||||||
| Hbac_isotig04539 | |||||||||
| Oden_isotig22808 | |||||||||
| CRC06770_1 | |||||||||
| HBC01331_1 | |||||||||
| MIC07750_1 | |||||||||
| MP01999 | |||||||||
| HC03982 | |||||||||
| MJC03856_1 | |||||||||
| FG583402.1 | |||||||||
| NB08659 | |||||||||
| CJC12463_1 | |||||||||
| GP00083 | |||||||||
| Associated_feature | WBsf644842 | ||||||||
| WBsf981361 | |||||||||
| WBsf222445 | |||||||||
| WBsf222446 | |||||||||
| WBsf222447 | |||||||||
| Experimental_info | RNAi_result | WBRNAi00037484 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||
| WBRNAi00062451 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00057423 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00020984 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| Expr_pattern | Expr9475 | ||||||||
| Expr1015378 | |||||||||
| Expr1035879 | |||||||||
| Expr1160857 | |||||||||
| Expr2007921 | |||||||||
| Expr2026163 | |||||||||
| Drives_construct | WBCnstr00029725 | ||||||||
| Construct_product | WBCnstr00014040 | ||||||||
| WBCnstr00029725 | |||||||||
| Microarray_results (21) | |||||||||
| Expression_cluster (93) | |||||||||
| Interaction (18) | |||||||||
| Map_info | Positive | Positive_clone | Y54G11A | Inferred_automatically | From sequence, transcript, pseudogene data | ||||
| Interpolated_map_position | II | 22.9082 | |||||||
| Reference | WBPaper00038444 | ||||||||
| WBPaper00038491 | |||||||||
| WBPaper00055090 | |||||||||
| WBPaper00061904 | |||||||||
| Method | Gene |
