WormBase Tree Display for RNAi: WBRNAi00063939

WBRNAi00063939 Homol: Homol_homol: C49A1:RNAi
  Sequence_info: DNA_text: gaagatctgaataaatacaaatactggaacaaggtaaaactatcaattgacccgaaaattgttttaaattgttaattgaagatattggaattatccgcccaacaaaaagttgtccagagcactgtaaagcttgtcgaggtccgtattggagttgagtggccatacgggaatgttaagctgcaaaataaaattttttagtgaaaaaaaaccaggaatttgtattattttgttggtagacgcattttttcatagctgcattattacaaaagttgtaagtgcacaggggtgggaatttcgggcaaattggcaatttgccggaattaaaaatttccggcaaattggcgaatttccggtattaaaaatttccagcgaattgacaaattgccggaattgaaaatttctggcaaattagcaaattgccggaaataaaaatttccggcaaaccggcatattgcctgaattaagaatttccagcagactggcaaattgccggaattaaaattttccggcaaatttttaagttttaagtgtttctgtcttataaaaaaatccctctaaacgattccggcaaattgatatcctgcaaacggcaaatcggcaatttgccggaattaaaattttccggcaaattgaaaaattgccggaattaaaaattttcggcaaatcgaaaaaccggcagtttgtggacttgccaaatttgtagacaaaaaacaattttcgaaactgccgccgacccttgaggtgcacaataaattttgaaccttcataagtcaacaggtaatagagcaatcaaaaaattattaacagacgaaatgtagcaaattttgtctacaatgttttgaatgttaacaactttttgataactccgatatatttgaagttacaggcctttaaagttaggcggctcatgttataagtccacaggtagttgagctatcaaaaagttgctccgaaacaaattgtagtgaattttttgtagacagttttgtcaatttgaaattttttaagaaacctattttcagcaaagttttagggtttgagctttgagcttgaaaaattgagctttgaagattggaaaacctttcgaaaattggaataactcggcagataattaaactatcgaaaacttgatacaagacaaattgtagaaaaattattgcagattatatttttaattagtagttttttgataactttaacaattccagagatataaggggttaaagtacacatacagagagcacttttttgggaaaaaaattcccgcattttctgtagatcaaaccattatgggacaaccggacaccacataaaaaggtgaaatggctcactttaaacccctataactttgcgggaaggtgagttataaaaatttggtaaactgacaaaatgaagcaaatttcttggagtttgattttgtaattaacatttttttaataacaataacagttctcaagctaaagaggttcaaagtttcagattaactttaaatacaaatatgtataaatctacgtagtaaaaagatatcaaaaacttgtgaaccaactaattatagcaaatttctccagctattcaaaaaaaaaccaaccctcttagcagaatttgccgtatccccagaagtaatgcatataaaactgcacttcttcccgaatctcgactgaatcttctcgaaaaccgactccttcccctgtttcgatatcgagtagatattctccacaggcaccgaagagttgagccctgagatcatcagttgagcagctccgagcacaagtccgtcgttggagagcactacattcgcgtatttttcagctgagagcttcgacttttccactacaaggtccatacaacgctgagcacatggccagcgttgaccgaaattggggagggtctggagctggattgcagactggtagagctctgtggcctcacgggctccaaatccgacgcgttccaggagctctgaaattttcaaatatttttttttggattttttttgaatatttatttatttttttttaatttaaaaaagttaccaaaattaaatccattctgctcctgcttaaacccagccacgtcattttttgtcgaattttctgtgtaaaattgccggaaagctgaatattttggtgcgacacgtcgcataacgtcaagtccacgtagattatcgattggtcccgagtccatggtggtttcatccacgacggcgtcctcgatattggtgatgtcaccttctaggaactgaaacatgaggaagatgagattttgaaggcgtttcagtgagaaattcgaaaagagcaagaaatttgtagcattttgagctaaaaaaattgatttttaaaagttcaaaaataaatttgaaaaaaaaattttcgaaaaaaattgattttttcaaacttctgaaaaatttttcatttttgatattttttgctgatttttggctcaaaatgctccaaatttttggaatttttattaaaaactttgttatatattttatgtgcgccaaaaacataataaaagatttttaaaacttcaaaatttaaatttaaaaaaaaaaaaatttttcaagattttgtaaagttgctcatttttgatattttttgctgatttttggctcaaattgctccaaatttttcacatttttagaaaactttatattttcgcgtttcagcatacatataaaattttaaaaaaaacttgaattatccaaaaaaaaaatcgaaaatttcaagtattcttaaaaattttttttgacatttaaattaatatttataggtattttttgtttaaaaaatttaactttaattaaaaaacttaaaataaatttattttaatttaaaattttacaaataaaaaatttcgaacctaaaaaatcacaaaaaactcacttaaaaaattttttaaaaacatttctcaattttcttaatttttatcaatttctatcaatttttagctcaaaatgctccaaatttcatgatctacacgattttcagtatgattttccattttctctactcacaaacctcattaacatctgcaaaattgttcaaagcgattctctccatcaaatgtgagacactattcgcggctcttgcataaaattcattagtatgagtaacagatgccaggtagttccgggaaatcaccgcaatatcgtcaatatcccaaataaagactctcgcgtaggtctcatcgcctggggagcaggagcccgtcttctttttcttggagaccttcggttttttctcctttaggctgaagcttgtgactgttgacgggacacctgtcgagccatctgatgaagttccgaggttgacggcatctgttcccaagaccgagctggctacactctaaaaattttaaatttaactttaaagctaattatcttaaaaactagccaagctatcaaaaagttgccaactaacaaaatattcatcacaaaatttcaaacatttttgtagttaaaaattttttgatagctttaaccgctgcagagttacaaaggtttgaagttggtggtgcagaaatagtgtggcggcggggagagtgcggagggggagagtgcgctgcgtctcccccttctccacactctctccgcctcgaggaagggcgccaactttaaaaccgggtaactttgaaaccagcatagctagagaaaagttgtcaaatgcaaaaatgtagcaaattttctgctcaacaatttttagttaacaaaatttatcggaaagcttttagttttggagatatgagagcctaaaagttgtaaacctcaaattttcaggggcaaaacactacttttatattttttatattatcatatttcctgtacgttctctacactttaaaatttaacccgaaaaattgaaaaaaaaatcaatagtttacaatttccccaagtggctcaatgcgatttcggacggctgccaatcagaagaccggggttcgagtccgcacggtggctaaatattttgttttggtgtttttagattaatttgggtatgaaaattttgaatttctacattacaaggcatgaaaacgctgtttttttaaaccctgaaaactttaaaactagaatagctagaaaaaaatttcgactgagaaaatgtaggaaatttttttttcttaacaatttgttagttcccaagtttaactaaaaaccttaatttcaaaaaaaaaacgaaccgcataagcagctgccgttgtcgcattcagcgggttgtagtacggagcagcggtgcctccacggagatttgtgtagtaggggttctgatatgccgccgccgccgatgtgtaatctaccggataacttcctgaaaactcgtatattagtatgaaggtctattcatttgacctaccgtaatacgagggcgttgtcagcgagtatgggaaggctgtggtgccggcacgcaggtttgcagtcacctgctgatagtagttggcaggatttgcagaggtgtacattgcgtattgaggataggagttgtattggtattgagatgttactgatgatgtaagggaggttgtggaagaggtggaacctggaaaataaaaaatataaatgaatattaaaggatgttttagaaaagtgaacataactttttttcgaattgagatatcaaaaaattgacaaattgcaaattgttccttacaaaattttaaacattttgttagctgaacactttttttagctctattagttccagagttacaggtgttcaaagatcgcgcgcctgagagagcgtgtggtggaaggagacgcagtgtgctatagctgtctgccacctcctcccgcacacactatttctcctgcctaactttgaaagcttgtaactctaaaaccacaacagctacggaaaagttttcaactaacgaaatactcaaaattttgtgaggaatgttttgttagttgacaacttttttctagcttttctagttttggaaatacaggcttagaaagggggggatgtctcctgaaccataaacgctaaggaaaagttgtcaac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yk1195a07
  Experiment: Laboratory: SA
    Date: 05 Aug 2005 00:00:00
    Genotype: pax-6(ju468)
    Treatment: L4 worms were soaked in the dsRNA solution for 24 h at 20C, recovered on NGM plates, incubated at 25C and F1 progeny scored
    Temperature: 25
    Delivered_by: Soaking
  Inhibits: Predicted_gene: C49A1.4b Inferred_automatically: RNAi_primary
      C49A1.4a Inferred_automatically: RNAi_primary
    Gene: WBGene00001377 Inferred_automatically: RNAi_primary
    Transcript: C49A1.4b.3 Inferred_automatically: RNAi_primary
      C49A1.4b.1 Inferred_automatically: RNAi_primary
      C49A1.4b.2 Inferred_automatically: RNAi_primary
      C49A1.4a.1 Inferred_automatically: RNAi_primary
  Species: Caenorhabditis elegans
  Reference: WBPaper00026796
  Phenotype: WBPhenotype:0000055 Remark: eya-1(RNAi) in the pax-6(ju468) mutant causes an increase in the percentage of animals that arrest as early larva.
  Remark: Entire sequence of clone used for RNAi not known as only the ends of the sequence were determined. The only target shown is the best match.
  Method: RNAi