WormBase Tree Display for Gene: WBGene00001483
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WBGene00001483 | SMap | S_parent | Sequence | C03C11 | |||||
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Identity | Version | 1 | |||||||
Name | CGC_name | fog-3 | Person_evidence | WBPerson261 | |||||
Sequence_name | C03C11.2 | ||||||||
Molecular_name | C03C11.2 | ||||||||
C03C11.2.1 | |||||||||
CE07874 | |||||||||
Other_name | CELE_C03C11.2 | Accession_evidence | NDB | BX284601 | |||||
Public_name | fog-3 | ||||||||
DB_info | Database | AceView | gene | 1K593 | |||||
WormQTL | gene | WBGene00001483 | |||||||
WormFlux | gene | WBGene00001483 | |||||||
NDB | locus_tag | CELE_C03C11.2 | |||||||
Panther | gene | CAEEL|WormBase=WBGene00001483|UniProtKB=G5EDX7 | |||||||
family | PTHR17537 | ||||||||
NCBI | gene | 172863 | |||||||
RefSeq | protein | NM_060245.6 | |||||||
TrEMBL | UniProtAcc | G5EDX7 | |||||||
UniProt_GCRP | UniProtAcc | G5EDX7 | |||||||
Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
History | Version_change | 1 | 07 Apr 2004 11:29:24 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from geneace | ||
Status | Live | ||||||||
Gene_info | Biotype | SO:0001217 | |||||||
Gene_class | fog | ||||||||
Allele (37) | |||||||||
Legacy_information | [C.elegansII] q469 : XX animals transformed into females, XO animals somatically male, make oocytes in germ line. q469/Df similar. No dominant phenotypes. ES3 (adult XX), ME0.OA>10: q441, q443, q470, q520fdi, q502uvp,oz137, oz147. [Ellis and Kimble 1995; RE] | ||||||||
Strain | WBStrain00022550 | ||||||||
WBStrain00022589 | |||||||||
WBStrain00022656 | |||||||||
WBStrain00022661 | |||||||||
WBStrain00040667 | |||||||||
WBStrain00004780 | |||||||||
WBStrain00005668 | |||||||||
WBStrain00005669 | |||||||||
WBStrain00048384 | |||||||||
RNASeq_FPKM (74) | |||||||||
GO_annotation (13) | |||||||||
Ortholog (34) | |||||||||
Paralog | WBGene00020380 | Caenorhabditis elegans | From_analysis | WormBase-Compara | |||||
Structured_description (2) | |||||||||
Molecular_info | Corresponding_CDS | C03C11.2 | |||||||
Corresponding_transcript | C03C11.2.1 | ||||||||
Other_sequence | AY589605.1 | ||||||||
Associated_feature | WBsf979085 | ||||||||
WBsf984884 | |||||||||
WBsf218378 | |||||||||
WBsf218379 | |||||||||
Experimental_info | RNAi_result (11) | ||||||||
Expr_pattern | Expr1244 | ||||||||
Expr9348 | |||||||||
Expr12584 | |||||||||
Expr1027248 | |||||||||
Expr1030885 | |||||||||
Expr1143617 | |||||||||
Expr2011867 | |||||||||
Expr2030105 | |||||||||
Drives_construct (15) | |||||||||
Construct_product (16) | |||||||||
Regulate_expr_cluster | WBPaper00048762:FOG-3_associated | ||||||||
WBPaper00054792:FOG-3_interacting | |||||||||
Microarray_results | SMD_C03C11.2 | ||||||||
187972_at | |||||||||
A_12_P105705 | |||||||||
Aff_C03C11.2 | |||||||||
GPL13394_WBGene00001483 | |||||||||
GPL13914_C03C11.2 | |||||||||
GPL14144_C03C11.2_10-69_0.896_11_A | |||||||||
GPL14144_C03C11.2_174-233_0.924_6_C | |||||||||
GPL14144_C03C11.2_309-368_0.779_40_B | |||||||||
GPL19516_CGZ0002144 | |||||||||
GPL21109_C03C11.2 | |||||||||
GPL3518_CE07874 | |||||||||
GPL8304_CE_WBGene00001483_A | |||||||||
GPL8304_CE_WBGene00001483_B | |||||||||
GPL8673_C03C11_2P00077 | |||||||||
GPL8673_C03C11_2P00360 | |||||||||
GPL8673_C03C11_2P00617 | |||||||||
GPL9450_C03C11.2 | |||||||||
cea2.c.00360 | |||||||||
Expression_cluster (173) | |||||||||
Interaction (64) | |||||||||
Anatomy_function | WBbtf0506 | ||||||||
Map_info | Map | I | Position | 4.49216 | Error | 0.029361 | |||
Well_ordered | |||||||||
Positive | Positive_clone | C03C11 | Person_evidence | WBPerson159 | |||||
Author_evidence | Chen P-J | ||||||||
Singal A | |||||||||
Inferred_automatically | From sequence, transcript, pseudogene data | ||||||||
Mapping_data | Multi_point (22) | ||||||||
Pos_neg_data | 8062 | ||||||||
8075 | |||||||||
8078 | |||||||||
8081 | |||||||||
8090 | |||||||||
8093 | |||||||||
8098 | |||||||||
8101 | |||||||||
8105 | |||||||||
8108 | |||||||||
8112 | |||||||||
8115 | |||||||||
8117 | |||||||||
8120 | |||||||||
6817 | |||||||||
6818 | |||||||||
6819 | |||||||||
8070 | |||||||||
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8132 | |||||||||
8137 | |||||||||
Reference (105) | |||||||||
Picture | WBPicture0000013095 | ||||||||
Method | Gene |