WormBase Tree Display for Gene: WBGene00015232
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WBGene00015232 | SMap | S_parent | Sequence | B0511 | |||||
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Identity | Version | 1 | |||||||
Name | Sequence_name | B0511.6 | |||||||
Molecular_name | B0511.6 | ||||||||
B0511.6.1 | |||||||||
CE26853 | |||||||||
Other_name | CELE_B0511.6 | Accession_evidence | NDB | BX284601 | |||||
Public_name | B0511.6 | ||||||||
DB_info | Database | AceView | gene | 1L203 | |||||
WormQTL | gene | WBGene00015232 | |||||||
WormFlux | gene | WBGene00015232 | |||||||
NDB | locus_tag | CELE_B0511.6 | |||||||
Panther | gene | CAEEL|WormBase=WBGene00015232|UniProtKB=O61815 | |||||||
family | PTHR24031 | ||||||||
NCBI | gene | 172954 | |||||||
RefSeq | protein | NM_060378.7 | |||||||
KEGG | KEGG_id | 3.6.4.13 | |||||||
NemaPath | KEGG_id | 3.6.4.13 | |||||||
TREEFAM | TREEFAM_ID | TF300471 | |||||||
TrEMBL | UniProtAcc | O61815 | |||||||
UniProt_GCRP | UniProtAcc | O61815 | |||||||
Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
History | Version_change | 1 | 28 May 2004 13:30:55 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from CDS class of stlace from WS125 | ||
Status | Live | ||||||||
Gene_info | Biotype | SO:0001217 | |||||||
Allele (27) | |||||||||
Strain | WBStrain00037234 | ||||||||
RNASeq_FPKM (74) | |||||||||
GO_annotation (14) | |||||||||
Contained_in_operon | CEOP1628 | ||||||||
Ortholog (37) | |||||||||
Paralog (37) | |||||||||
Structured_description | Concise_description | B0511.6 encodes a DEAD-box helicase; loss of B0511.6 activity via RNAi indicates that B0511.6 activity is required for larval development. | Paper_evidence | WBPaper00006395 | |||||
WBPaper00025054 | |||||||||
WBPaper00031057 | |||||||||
Curator_confirmed | WBPerson1843 | ||||||||
Date_last_updated | 09 Oct 2007 00:00:00 | ||||||||
Automated_description | Predicted to enable several functions, including ATP binding activity; ATP hydrolysis activity; and RNA helicase activity. Predicted to be involved in maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA). Predicted to be located in nucleolus. Expressed in head and tail. Is an ortholog of human DDX18 (DEAD-box helicase 18). | Paper_evidence | WBPaper00065943 | ||||||
Curator_confirmed | WBPerson324 | ||||||||
WBPerson37462 | |||||||||
Inferred_automatically | This description was generated automatically by a script based on data from the WS291 version of WormBase | ||||||||
Date_last_updated | 29 Nov 2023 00:00:00 | ||||||||
Molecular_info | Corresponding_CDS | B0511.6 | |||||||
Corresponding_transcript | B0511.6.1 | ||||||||
Other_sequence | AS04026 | ||||||||
Oden_isotig02401 | |||||||||
AS09680 | |||||||||
FF678677.1 | |||||||||
Dviv_isotig14665 | |||||||||
FE916858.1 | |||||||||
ACC00614_2 | |||||||||
FC545672.1 | |||||||||
ASC00784_1 | |||||||||
HC02827 | |||||||||
AS06521 | |||||||||
ACC00614_1 | |||||||||
PPC09114_1 | |||||||||
FE916639.1 | |||||||||
JI168946.1 | |||||||||
EY470778.1 | |||||||||
HG02008 | |||||||||
Oden_isotig02402 | |||||||||
FE916983.1 | |||||||||
GW714089.1 | |||||||||
EX557779.1 | |||||||||
TSC05594_1 | |||||||||
EY458703.1 | |||||||||
HCC00475_1 | |||||||||
Hbac_isotig01224 | |||||||||
EY471938.1 | |||||||||
Tcir_isotig01789 | |||||||||
Dviv_isotig14667 | |||||||||
BXC02637_1 | |||||||||
EX551832.1 | |||||||||
HG01729 | |||||||||
CJC02721_1 | |||||||||
HBC02052_1 | |||||||||
CR02408 | |||||||||
Tcir_isotig01787 | |||||||||
CJC11872_1 | |||||||||
GW714090.1 | |||||||||
JI472365.1 | |||||||||
ES410510.1 | |||||||||
GR977799.1 | |||||||||
FE916947.1 | |||||||||
Oden_isotig26024 | |||||||||
OVC07626_1 | |||||||||
FC540954.1 | |||||||||
AYC01249_1 | |||||||||
PPC09880_1 | |||||||||
FC542170.1 | |||||||||
FK805025.1 | |||||||||
EL740220.1 | |||||||||
RSC04300_1 | |||||||||
FK807987.1 | |||||||||
FG619826.1 | |||||||||
JI480752.1 | |||||||||
EY467701.1 | |||||||||
Oden_isotig02399 | |||||||||
HBC03439_1 | |||||||||
GT738147.1 | |||||||||
FE916840.1 | |||||||||
Tcol_isotig21524 | |||||||||
Name_isotig02869 | |||||||||
HGC01484_1 | |||||||||
FC544720.1 | |||||||||
Acan_isotig07753 | |||||||||
ES584520.1 | |||||||||
EY468637.1 | |||||||||
Tcir_isotig01790 | |||||||||
JO467840.1 | |||||||||
EY469114.1 | |||||||||
EY465878.1 | |||||||||
AS01917 | |||||||||
Oden_isotig02403 | |||||||||
CBC02371_1 | |||||||||
CRC00057_1 | |||||||||
ACC06096_1 | |||||||||
BE721003.1 | |||||||||
AS17831 | |||||||||
EY469360.1 | |||||||||
Oden_isotig02400 | |||||||||
EX563791.1 | |||||||||
FF678346.1 | |||||||||
Tcir_isotig01788 | |||||||||
FE906305.1 | |||||||||
SC00768 | |||||||||
FC542192.1 | |||||||||
HBC16478_1 | |||||||||
Dviv_isotig14666 | |||||||||
EY473382.1 | |||||||||
Oden_contig04185 | |||||||||
AE02132 | |||||||||
EL740213.1 | |||||||||
FE911964.1 | |||||||||
TS02560 | |||||||||
Associated_feature | WBsf034264 | ||||||||
WBsf656891 | |||||||||
WBsf218468 | |||||||||
WBsf218469 | |||||||||
WBsf218470 | |||||||||
Experimental_info | RNAi_result (13) | ||||||||
Expr_pattern (7) | |||||||||
Drives_construct | WBCnstr00002099 | ||||||||
WBCnstr00028985 | |||||||||
Construct_product | WBCnstr00028985 | ||||||||
Microarray_results (25) | |||||||||
Expression_cluster (128) | |||||||||
Interaction (288) | |||||||||
Map_info | Positive | Positive_clone | B0511 | Inferred_automatically | From sequence, transcript, pseudogene data | ||||
Interpolated_map_position | I | 5.05891 | |||||||
Reference | WBPaper00029254 | ||||||||
WBPaper00038491 | |||||||||
WBPaper00042178 | |||||||||
WBPaper00055090 | |||||||||
WBPaper00064339 | |||||||||
WBPaper00064934 | |||||||||
Method | Gene |