WormBase Tree Display for RNAi: WBRNAi00063487
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WBRNAi00063487 | Homol | Homol_homol | F26D11:RNAi | ||
---|---|---|---|---|---|
R13H4:RNAi | |||||
Sequence_info | DNA_text | tcaaagatggcaatacaaaaattgctaaaattgattgaaactatttgatgaatttttttgtctaatgttttatacgtttgctgatacgttgtgatttaaagaagttcaaaaagatgagctaggaaaaaatctttataaataatttttgacttttaaagtcttcaaatcagttttaaactaatattcagaagtctacattttttatactgatcaatggaacatttttcatgcatgttgcggcttgaaaaatctgtgcattttgatttttataacgaaatccacaaggttaatgaaatcaattataaatcgttgaaattgcgctgcactagaattacccagaaacattttgggaattaatcaatttttctctgaatcaaccgccaaaaatagagtttatcatgtgctcttccggaacaaaattgcacaagatttgaagatgattaaagcacattcaataaaaatattcgtaaaagatactacactctcgttgtatgtcgattattcattcgaggtcagagtaatagaatattgaagagtcaatctagttactacattccgttttccaagaaagccgtctcatttccattagattcaggtgacgccaatagttagtttttcaaagaaaactttttatgggtttccaggttttcactggaacatggtgttaccaagtttttcggcttgacccctttttcctcttcgaatgcataccggttactattgagtttgtcaaaaattgtttcaactttcagactatagaataacattttgatagcacaaagatccaccaagaatggaaacggaatagtaaacgatacaatacttactggaacataaactaattttgcataattttgctaaatttcttttaattttgaacggttctaattttcaaagctcctttttgtataaatttttatttgaaagttgaaagttacaacataagaaacagttatggtatttgttccttttcgaccaaagcaaaatactttgggtcaggctattaatttttgaagtaactcctttttaaacagaattttctagattttctagtgagtagtatactactgctatcgagtccaccgccagaaagaaaatactcgaaacgtgagaaatcctcggaagagaggggattgagttgaagagagacgaaaaagagggaaaattgattagtggtgttatgaatgtgtgaccctgttataaaatgaatatgacgatgcacttttcgatgcaatctccctctctgctcttcacgtgtgctccagacgagaaaaaaaggatgcagaggagacaagtgataacaatgaatttgtctcagttggataacggtgagtgttgttgccaggtgagccagagtgcgtgagtctcttacttcaaccaccaccactacctcatcacactgaaatgaaagggggttggttagagagctccgctaatctcttctcgccttctcttctttccagagcttgagaaggtgtgggaagaggggacgagaaagagaaaacgacgtagacccaattgatatccatatcttgttttctttacttgactctccacactctataaagacatcgtctcgtttgccagaaagaaaatgggcgggacattaggcttctctccgtgtccctcgacttctaatcactatacattttttggtggataagaagagctgcatgatcaatataagaagcttatcagtttgcattgctctattgaaaactgaaggatagagagagagagagactggccggtctggaaaaatgatgaatagacggttaattaggtgtttggagatcaaacatgaccatgaaaagcgccgtaacgaaacgaagggacgaaaatattgaaaattggaagagtcttgaaaagagccacataattggtagttggaaaattgtatatgttgttgtgaacgtaacatttaaatatatattcaagggggtactaggtctacaaagattaaatgttgatctcagaacttcaacttttacgagagagctgtggtagttttaggtgtaaaacagacaaatgaaaatttctcagaaaaaagacaggtatgtaatttttctgctgtaatttatctgtcaaacttgttcatccttgcaataaatctgatttataattttcaatggatctttttggaagcctatgcagctagggttttaagcccgtatttgaagtacattaagatgatgtcgtgaaaaaaaagcgttaagaaatatacgcaatttatttttttatatatgtagccccaaaacaaaactcatttttgagtttgtatcacgacccggttcataaagtcaaattacacggcaacgtgtaagtccgtaaatgctgaacatattttctgaaaggagaaactctggaaatgttctcagtgatttggtgaacaaatttccttgctttattttagaatatacagtttaatttgaaatttacaagatcatactgaaaacaaacacaatcttcatttcatctattctaaaatgttttcacttatcattaaaaaaaatagcttaaagctcaaatactcgataaaatactcgaattttttcaaatgtaaaaatgatcaaaatcgattgattttctgccagacatcgtataatttattttaaaaaatgggtccgcaaaccttcaaaacattttttgaaaactcacggtttctgttttcaatatttcagatttagctacggttctacgtagaaattagtatgatgaaaatttgcccttataaaaactgtggatcgcacaaacttgtttccatgtgaaaaaaaattttaaacttatttataaaattaaaataaaaatttcaaaaagttacatagaaaaaaaaacagttggaaaaacagtggaaaaagatacttacaattagaagtaaagcccaaaagtattgaagcaggaaaagtgtacgaatgttgtgtgagctcatgagagttgggtaaatcaatgacaaaaataaaaacaattaacaacaaagggagagtaatcacaacttttgaattgaggcctgtatttttgagtgggagagaaagaatatggaaatgattgtttgattattttttgttgcagtttgattagtgtaaaatgagacacgaaacatgaaatcaagaaataatagaaacatgaaatgtgaaaaatcaataagttaaactttggtattaaagctcgtagaggaaaagtgaattttagtgaggaagaagcgtttttttgttttgaatattgaaaattttgaacatcacatgtattgatacaggtaatttttagataaaggaggttagtaaggaagaaatatcacagattaggaagcatacacgggagtacttgatgtcacgaacatggtgctgtccggagaacccgcatcaaagtggttgagctgatgagaactgccattcaggcttggctcctgaagaaatgaataaattatttcagatgaactagaggaagttttaaataacattatttatctccttttttgttttgagtctcaatctagacgaaacaaattcgttatggtcaaaaaatagaaatcaattttagtaagctaagtatactttcgtcagagaagagttgccgattggtattccgattggttggacattaagagcataattaaaataaatttatgttttcgatactatctgaaattcacttttgaaccaaataggacaatttgagtgtgaaaccacttgttttttgtcatcaaaaatccaaacttttggcagagaataaatatttttgaattattttcaaatttttaaattttgccagtgaatcacgaatgtcaaaaaaaaaacgtctaatgtctagttttcagccaaaatcggcctcaatactcacatggcctactcacagatgttctcgaaactggcgatggggaccgccttaacacgactaattctaccgtttctcgctttttgatcgcctccattgcattatcctgagatgcgttgatcatgttcacatcgttagcacgaatcaatttgtctccttcacgaagaccacatctgtatgcagcacttccaggtgtgactttggtgacaaaaagtcctgaatctccgttactgttcggcgccggatcgttcgaggttccgccagcgaaggaaagtcccaatctacaaaaattaaataggttttttaatttcgttcattttttcgattgttagttattgttttattaagaacattgataaatcattttgtgtaacctagatgtatactcattctttcaataaatttattttacgatacattagaaaataagaaaaaggctactacttttttaatgctataattgtttttcatattataaataattaaaaaatgaactacatatataattcccttctttttaatctggacagctcaaaaattaacaaaagataaaaaaataccgtgtttcctctatttgtcttgtaacctaacgtaccaatcaaaagtaagttttgtagcttctaatattttttctatgaaatgttgaaaactttgccgttttcagggtcgaaaaaacttagacacatccaaggcgtcaagaaatttatggaaaagtatgcgttaaattctaaagggctcctagattgattttttccaaagctgcattcgaaaattagtatggtgtccctacaaataaaattaaaattgtctcgcatgcaatactattaggtctctatttttgcaatactatatacgtaatatatg | yk126a10 | ||
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| yk675e4 | ||||
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Experiment | Laboratory | OLB | |||
Date | 10 Oct 2003 00:00:00 | ||||
Strain | WBStrain00000001 | ||||
Delivered_by | Injection | ||||
Inhibits | Predicted_gene (12) | ||||
Gene | WBGene00001978 | Inferred_automatically | RNAi_primary | ||
WBGene00002632 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||
Transcript (13) | |||||
Species | Caenorhabditis elegans | ||||
Reference | WBPaper00006400 | ||||
Phenotype_not_observed | WBPhenotype:0001657 | Remark | hmp-1 RNAi suppresses the defect caused by let-413 RNAi in apical junction formation in the gut epithelium. | ||
Remark | the suppression of the apical junction formation defect was determined using DLG-1 antibodies | ||||
Entire sequence of clone used for RNAi not known as only the ends of the sequence were determined. The only target shown is the best match. | |||||
Method | RNAi |