WormBase Tree Display for Gene: WBGene00012149
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| WBGene00012149 | SMap | S_parent | Sequence | CHROMOSOME_II | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identity | Version | 1 | |||||||
| Name | Sequence_name | VF13D12L.3 | |||||||
| Molecular_name | VF13D12L.3 | ||||||||
| VF13D12L.3.1 | |||||||||
| CE21229 | |||||||||
| Other_name | CELE_VF13D12L.3 | Accession_evidence | NDB | BX284602 | |||||
| Public_name | VF13D12L.3 | ||||||||
| DB_info | Database | AceView | gene | 2M3 | |||||
| WormQTL | gene | WBGene00012149 | |||||||
| WormFlux | gene | WBGene00012149 | |||||||
| NDB | locus_tag | CELE_VF13D12L.3 | |||||||
| Panther | gene | CAEEL|WormBase=WBGene00012149|UniProtKB=G5EDW8 | |||||||
| family | PTHR11091 | ||||||||
| NCBI | gene | 174795 | |||||||
| RefSeq | protein | NM_064099.8 | |||||||
| TREEFAM | TREEFAM_ID | TF312887 | |||||||
| TrEMBL | UniProtAcc | G5EDW8 | |||||||
| UniProt_GCRP | UniProtAcc | G5EDW8 | |||||||
| Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
| History | Version_change | 1 | 26 May 2004 16:54:53 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from CDS class of WS125 | ||
| Status | Live | ||||||||
| Gene_info | Biotype | SO:0001217 | |||||||
| Allele (162) | |||||||||
| RNASeq_FPKM (74) | |||||||||
| GO_annotation | 00014939 | ||||||||
| 00119331 | |||||||||
| Contained_in_operon | CEOP2572 | ||||||||
| Ortholog (29) | |||||||||
| Paralog | WBGene00009453 | Caenorhabditis elegans | From_analysis | Panther | |||||
| WormBase-Compara | |||||||||
| Structured_description | Concise_description | VF13D12L.3 is orthologous to the human gene ARGININOSUCCINATE SYNTHETASE (ASS; OMIM:603470), which when mutated leads to classic citrullinemia. | Curator_confirmed | WBPerson1823 | |||||
| WBPerson567 | |||||||||
| Date_last_updated | 06 Aug 2004 00:00:00 | ||||||||
| Automated_description | Predicted to enable oxidoreductase activity. | Paper_evidence | WBPaper00065943 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson324 | ||||||||
| WBPerson37462 | |||||||||
| Inferred_automatically | This description was generated automatically by a script based on data from the WS291 version of WormBase | ||||||||
| Date_last_updated | 29 Nov 2023 00:00:00 | ||||||||
| Molecular_info | Corresponding_CDS | VF13D12L.3 | |||||||
| Corresponding_transcript | VF13D12L.3.1 | ||||||||
| Other_sequence | HBC11683_1 | ||||||||
| CSC00401_1 | |||||||||
| Tcir_isotig22820 | |||||||||
| SSC00155_1 | |||||||||
| Oden_isotig10203 | |||||||||
| MI00022 | |||||||||
| DVC00736_1 | |||||||||
| HGC02723_1 | |||||||||
| Oden_isotig10202 | |||||||||
| MIC00604_2 | |||||||||
| SS00422 | |||||||||
| FC815340.1 | |||||||||
| TM01973 | |||||||||
| Oden_isotig10205 | |||||||||
| HG03115 | |||||||||
| GP03363 | |||||||||
| SS00825 | |||||||||
| SRC02108_1 | |||||||||
| FC814406.1 | |||||||||
| FC820463.1 | |||||||||
| CBC03448_1 | |||||||||
| SRC05820_1 | |||||||||
| SSC02594_1 | |||||||||
| MIC00604_1 | |||||||||
| MP00033 | |||||||||
| FD517690.1 | |||||||||
| EV852626.1 | |||||||||
| GPC02713_1 | |||||||||
| ES739303.1 | |||||||||
| CGC00445_1 | |||||||||
| EX539437.1 | |||||||||
| MI00910 | |||||||||
| Hbac_isotig01830 | |||||||||
| Tcol_isotig05816 | |||||||||
| TIC00285_1 | |||||||||
| Oden_isotig10206 | |||||||||
| SR05055 | |||||||||
| CBC03875_1 | |||||||||
| ACC08863_1 | |||||||||
| SS00184 | |||||||||
| JI171683.1 | |||||||||
| CRC06581_1 | |||||||||
| Name_isotig01388 | |||||||||
| BXC04607_1 | |||||||||
| Oden_isotig10207 | |||||||||
| DVC01949_1 | |||||||||
| FC809975.1 | |||||||||
| Acan_isotig09491 | |||||||||
| TMC01721_1 | |||||||||
| MPC00049_1 | |||||||||
| MI02279 | |||||||||
| CJC05260_1 | |||||||||
| Oden_isotig10204 | |||||||||
| SR01797 | |||||||||
| CGC01485_1 | |||||||||
| SSC02422_1 | |||||||||
| EV853436.1 | |||||||||
| EV853719.1 | |||||||||
| Tcol_isotig05815 | |||||||||
| AJ616519.1 | |||||||||
| Tcol_isotig05817 | |||||||||
| EV852818.1 | |||||||||
| FK803912.1 | |||||||||
| EV850821.1 | |||||||||
| FG973579.1 | |||||||||
| Associated_feature (11) | |||||||||
| Experimental_info | RNAi_result | WBRNAi00013212 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||
| WBRNAi00022456 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00054467 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00036117 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| Expr_pattern | Expr1027544 | ||||||||
| Expr1035374 | |||||||||
| Expr1158013 | |||||||||
| Expr2006645 | |||||||||
| Expr2024862 | |||||||||
| Microarray_results (21) | |||||||||
| Expression_cluster (178) | |||||||||
| Interaction (16) | |||||||||
| Map_info | Positive | Positive_clone | VF13D12L | Inferred_automatically | From sequence, transcript, pseudogene data | ||||
| Interpolated_map_position | II | 3.99608 | |||||||
| Reference | WBPaper00027145 | ||||||||
| Method | Gene |
