WormBase Tree Display for Gene: WBGene00006802
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WBGene00006802 | SMap | S_parent | Sequence | T07A5 | |||||
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Identity | Version | 2 | |||||||
Name | CGC_name | unc-69 | Paper_evidence | WBPaper00027646 | |||||
Person_evidence | WBPerson261 | ||||||||
Sequence_name | T07A5.6 | ||||||||
Molecular_name | T07A5.6a | ||||||||
T07A5.6a.1 | |||||||||
CE23955 | |||||||||
T07A5.6b | |||||||||
CE38102 | |||||||||
T07A5.6c | |||||||||
CE41450 | |||||||||
T07A5.6b.1 | |||||||||
T07A5.6c.1 | |||||||||
Other_name | CELE_T07A5.6 | Accession_evidence | NDB | BX284603 | |||||
Public_name | unc-69 | ||||||||
DB_info | Database | AceView | gene | 3L409 | |||||
WormFlux | gene | WBGene00006802 | |||||||
NDB | locus_tag | CELE_T07A5.6 | |||||||
Panther | gene | CAEEL|WormBase=WBGene00006802|UniProtKB=A7LPF8 | |||||||
family | PTHR21614 | ||||||||
NCBI | gene | 176444 | |||||||
RefSeq | protein | NM_001027582.4 | |||||||
NM_001027581.5 | |||||||||
NM_001129245.5 | |||||||||
TREEFAM | TREEFAM_ID | TF323340 | |||||||
TrEMBL | UniProtAcc | A7LPF8 | |||||||
Q9U377 | |||||||||
G5EDQ5 | |||||||||
UniProt_GCRP | UniProtAcc | A7LPF8 | |||||||
Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
History | Version_change | 1 | 07 Apr 2004 11:29:43 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from geneace | ||
2 | 30 Oct 2007 10:02:14 | WBPerson2970 | Event | Acquires_merge | WBGene00044098 | ||||
Name_change | Sequence_name | T07A5.6 | |||||||
Acquires_merge | WBGene00044098 | ||||||||
Status | Live | ||||||||
Gene_info | Biotype | SO:0001217 | |||||||
Gene_class | unc | ||||||||
Reference_allele | WBVar00143321 | ||||||||
Allele (18) | |||||||||
Legacy_information | e587 : medium coiler inactive small; abnormalities in VD and DD commissures. ES3 ME0. NA2 (e602). | ||||||||
[C.elegansII] e587 : medium coiler, inactive, small; abnormalities in VD and DD commissures, longitudinal axon elongation. ES3 ME0. OA1: e602. Cloned: cosmid rescue (C46D2). [Brenner 1974; NG; SQ; WS] | |||||||||
Strain (16) | |||||||||
RNASeq_FPKM (74) | |||||||||
GO_annotation | 00005135 | ||||||||
00005136 | |||||||||
00005137 | |||||||||
00005138 | |||||||||
00005139 | |||||||||
00005140 | |||||||||
00005141 | |||||||||
00005142 | |||||||||
00005143 | |||||||||
Ortholog (36) | |||||||||
Structured_description (2) | |||||||||
Molecular_info | Corresponding_CDS | T07A5.6a | |||||||
T07A5.6b | |||||||||
T07A5.6c | |||||||||
Corresponding_transcript | T07A5.6a.1 | ||||||||
T07A5.6b.1 | |||||||||
T07A5.6c.1 | |||||||||
Other_sequence (59) | |||||||||
Associated_feature (12) | |||||||||
Experimental_info | RNAi_result | WBRNAi00035291 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||
WBRNAi00062360 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
Expr_pattern | Expr4900 | ||||||||
Expr7838 | |||||||||
Expr1016022 | |||||||||
Expr1032870 | |||||||||
Expr1156304 | |||||||||
Expr2017899 | |||||||||
Expr2036035 | |||||||||
Drives_construct | WBCnstr00001400 | ||||||||
WBCnstr00012320 | |||||||||
WBCnstr00012950 | |||||||||
Construct_product | WBCnstr00001400 | ||||||||
WBCnstr00012320 | |||||||||
WBCnstr00012950 | |||||||||
Microarray_results (25) | |||||||||
Expression_cluster (123) | |||||||||
Interaction | WBInteraction000008990 | ||||||||
WBInteraction000522715 | |||||||||
WBInteraction000522716 | |||||||||
WBInteraction000547046 | |||||||||
Map_info | Map | III | Position | 2.3102 | Error | 0.00237 | |||
Well_ordered | |||||||||
Positive | Inside_rearr | nDf40 | |||||||
Positive_clone | T07A5 | Inferred_automatically | From sequence, transcript, pseudogene data | ||||||
Negative | Outside_rearr | tnDf2 | |||||||
Mapping_data | 2_point | 72 | |||||||
578 | |||||||||
702 | |||||||||
5137 | |||||||||
6121 | |||||||||
Multi_point (75) | |||||||||
Pos_neg_data | 362 | ||||||||
669 | |||||||||
1597 | |||||||||
1620 | |||||||||
4768 | |||||||||
8638 | |||||||||
9454 | |||||||||
10533 | |||||||||
Reference (52) | |||||||||
Remark | on same cosmid as unc-50; genetic map data indicate unc-69 left of unc-50 JAH 01/01 | ||||||||
Method | Gene |