WormBase Tree Display for Gene: WBGene00004856
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| WBGene00004856 | SMap | S_parent | Sequence | CHROMOSOME_III | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identity | Version | 1 | |||||||
| Name | CGC_name | sma-2 | Person_evidence | WBPerson261 | |||||
| Sequence_name | ZK370.2 | ||||||||
| Molecular_name | ZK370.2a | ||||||||
| ZK370.2a.1 | |||||||||
| CE33015 | |||||||||
| ZK370.2b | |||||||||
| CE53267 | |||||||||
| ZK370.2a.2 | |||||||||
| ZK370.2b.1 | |||||||||
| Other_name | cem-1 | ||||||||
| CELE_ZK370.2 | Accession_evidence | NDB | BX284603 | ||||||
| Public_name | sma-2 | ||||||||
| DB_info | Database (11) | ||||||||
| Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
| History | Version_change | 1 | 07 Apr 2004 11:29:36 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from geneace | ||
| Status | Live | ||||||||
| Gene_info (11) | |||||||||
| Disease_info | Potential_model (16) | ||||||||
| Molecular_info | Corresponding_CDS | ZK370.2a | |||||||
| ZK370.2b | |||||||||
| Corresponding_CDS_history | ZK370.2:wp91 | ||||||||
| Corresponding_transcript | ZK370.2a.1 | ||||||||
| ZK370.2a.2 | |||||||||
| ZK370.2b.1 | |||||||||
| Other_sequence (74) | |||||||||
| Associated_feature (11) | |||||||||
| Transcription_factor | WBTranscriptionFactor001120 | ||||||||
| Experimental_info | RNAi_result (12) | ||||||||
| Expr_pattern | Chronogram1005 | ||||||||
| Expr7207 | |||||||||
| Expr1011006 | |||||||||
| Expr1032408 | |||||||||
| Expr1162804 | |||||||||
| Expr2015892 | |||||||||
| Expr2034125 | |||||||||
| Drives_construct | WBCnstr00001867 | ||||||||
| WBCnstr00001868 | |||||||||
| WBCnstr00001869 | |||||||||
| WBCnstr00003254 | |||||||||
| WBCnstr00035354 | |||||||||
| Construct_product | WBCnstr00001867 | ||||||||
| WBCnstr00001868 | |||||||||
| WBCnstr00001869 | |||||||||
| WBCnstr00035354 | |||||||||
| WBCnstr00038798 | |||||||||
| Regulate_expr_cluster | WBPaper00037682:sma-2_downregulated | ||||||||
| WBPaper00037682:sma-2_sma-4_downregulated | |||||||||
| WBPaper00037682:sma-2_sma-4_upregulated | |||||||||
| WBPaper00037682:sma-2_upregulated | |||||||||
| WBPaper00053184:sma-2(rax5)_downregulated | |||||||||
| WBPaper00053184:sma-2(rax5)_upregulated | |||||||||
| Microarray_results (22) | |||||||||
| Expression_cluster (124) | |||||||||
| Interaction (247) | |||||||||
| WBProcess | WBbiopr:00000025 | ||||||||
| WBbiopr:00000039 | |||||||||
| Map_info | Map | III | Position | -0.072089 | Error | 0.00314 | |||
| Well_ordered | |||||||||
| Positive | Positive_clone | PAR2 | |||||||
| ZK370 | Author_evidence | Savage C | |||||||
| Inferred_automatically | From sequence, transcript, pseudogene data | ||||||||
| Negative | Outside_rearr | tnDf2 | |||||||
| Mapping_data | 2_point (17) | ||||||||
| Multi_point | 60 | ||||||||
| 61 | |||||||||
| 62 | |||||||||
| 63 | |||||||||
| 69 | |||||||||
| 71 | |||||||||
| 72 | |||||||||
| 88 | |||||||||
| 92 | |||||||||
| 379 | |||||||||
| 428 | |||||||||
| 429 | |||||||||
| 752 | |||||||||
| 759 | |||||||||
| 760 | |||||||||
| 761 | |||||||||
| 1414 | |||||||||
| 1416 | |||||||||
| 1418 | |||||||||
| 1664 | |||||||||
| 1666 | |||||||||
| 1668 | |||||||||
| 1717 | |||||||||
| 1729 | |||||||||
| 1732 | |||||||||
| 1734 | |||||||||
| 1753 | |||||||||
| 1813 | |||||||||
| 1836 | |||||||||
| 1863 | |||||||||
| 2035 | |||||||||
| 2184 | |||||||||
| 2197 | |||||||||
| 2199 | |||||||||
| 3260 | |||||||||
| 3365 | |||||||||
| 3367 | |||||||||
| 3722 | |||||||||
| 3775 | |||||||||
| 3888 | |||||||||
| 3895 | |||||||||
| 4313 | |||||||||
| 5287 | |||||||||
| Pos_neg_data | 360 | ||||||||
| 801 | |||||||||
| 817 | |||||||||
| 6103 | |||||||||
| 6104 | |||||||||
| 6106 | |||||||||
| 2718 | |||||||||
| 5142 | |||||||||
| 9450 | |||||||||
| 10534 | |||||||||
| Reference (168) | |||||||||
| Picture | WBPicture0000013077 | ||||||||
| Remark | [Savage C] sma-2 cDNA spans ZK370 and pAR2, and includes most of the Genefinder predicted ORF ZK370.2 | ||||||||
| cem-1 appears to be the same gene as this. The two sequences PAR2.2 and ZK370.2 come from cem-1 and the positive clones. sdm 12/00 | |||||||||
| this gene crosses stl and cam boundary, hence predicted in 2 parts. sdm 01.01 | |||||||||
| Method | Gene |
