WormBase Tree Display for Gene: WBGene00004003
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| WBGene00004003 | SMap | S_parent | Sequence | CHROMOSOME_V | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identity | Version | 1 | |||||||
| Name | CGC_name | pgp-9 | Person_evidence | WBPerson490 | |||||
| Sequence_name | C47A10.1 | ||||||||
| Molecular_name | C47A10.1 | ||||||||
| C47A10.1.1 | |||||||||
| CE15714 | |||||||||
| Other_name | CELE_C47A10.1 | Accession_evidence | NDB | BX284605 | |||||
| Public_name | pgp-9 | ||||||||
| DB_info | Database | AceView | gene | 5S243 | |||||
| WormQTL | gene | WBGene00004003 | |||||||
| WormFlux | gene | WBGene00004003 | |||||||
| NDB | locus_tag | CELE_C47A10.1 | |||||||
| Panther | gene | CAEEL|WormBase=WBGene00004003|UniProtKB=G5EG58 | |||||||
| family | PTHR24221 | ||||||||
| NCBI | gene | 180165 | |||||||
| RefSeq | protein | NM_075086.6 | |||||||
| TrEMBL | UniProtAcc | G5EG58 | |||||||
| UniProt_GCRP | UniProtAcc | G5EG58 | |||||||
| OMIM | gene | 171050 | |||||||
| 171060 | |||||||||
| 603201 | |||||||||
| Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
| History | Version_change | 1 | 07 Apr 2004 11:29:33 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from geneace | ||
| Status | Live | ||||||||
| Gene_info (9) | |||||||||
| Disease_info | Potential_model (41) | ||||||||
| Molecular_info | Corresponding_CDS | C47A10.1 | |||||||
| Corresponding_transcript | C47A10.1.1 | ||||||||
| Other_sequence | Name_isotig00941 | ||||||||
| ACC29929_1 | |||||||||
| GO254812.1 | |||||||||
| Tcol_isotig19128 | |||||||||
| DN153428.1 | |||||||||
| HC04633 | |||||||||
| FC546014.1 | |||||||||
| HCC00168_2 | |||||||||
| JI180170.1 | |||||||||
| FG972896.1 | |||||||||
| Oden_isotig10942 | |||||||||
| ACC17188_1 | |||||||||
| BUC00542_1 | |||||||||
| JI222082.1 | |||||||||
| DN557913.1 | |||||||||
| HC05918 | |||||||||
| Oden_isotig24642 | |||||||||
| LSC00905_1 | |||||||||
| Oden_isotig27971 | |||||||||
| EX554453.1 | |||||||||
| EY461473.1 | |||||||||
| CJC14002_1 | |||||||||
| GR14048 | |||||||||
| Tcol_isotig16918 | |||||||||
| EB763519.1 | |||||||||
| HC05917 | |||||||||
| FR691850.1 | |||||||||
| JI166507.1 | |||||||||
| Tcol_isotig23436 | |||||||||
| HC05914 | |||||||||
| HC05909 | |||||||||
| Oden_isotig10944 | |||||||||
| HCC09740_1 | |||||||||
| JO467866.1 | |||||||||
| JI257327.1 | |||||||||
| EY471572.1 | |||||||||
| ASC38488_1 | |||||||||
| HC05916 | |||||||||
| ACC29144_1 | |||||||||
| Tcir_isotig26704 | |||||||||
| Hbac_isotig07027 | |||||||||
| JI172889.1 | |||||||||
| GRC03467_1 | |||||||||
| HBC25899_1 | |||||||||
| Oden_isotig10943 | |||||||||
| JI177174.1 | |||||||||
| HBC18691_1 | |||||||||
| FR691848.1 | |||||||||
| Acan_isotig08065 | |||||||||
| FC544788.1 | |||||||||
| Associated_feature | WBsf982069 | ||||||||
| WBsf1002739 | |||||||||
| WBsf1021340 | |||||||||
| Experimental_info | RNAi_result | WBRNAi00077359 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||
| WBRNAi00070085 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00042636 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00012052 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00001328 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00022567 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| Expr_pattern | Chronogram1652 | ||||||||
| Expr3340 | |||||||||
| Expr5518 | |||||||||
| Expr5519 | |||||||||
| Expr1024605 | |||||||||
| Expr1031915 | |||||||||
| Expr1146620 | |||||||||
| Expr2014876 | |||||||||
| Expr2033111 | |||||||||
| Drives_construct | WBCnstr00002006 | ||||||||
| WBCnstr00002007 | |||||||||
| WBCnstr00004037 | |||||||||
| WBCnstr00011336 | |||||||||
| Microarray_results (19) | |||||||||
| Expression_cluster (251) | |||||||||
| Interaction (24) | |||||||||
| Map_info | Map | V | Position | 13.1928 | Error | 0.00649 | |||
| Positive | Positive_clone | C47A10 | Inferred_automatically | From CDS info | |||||
| From sequence, transcript, pseudogene data | |||||||||
| Mapping_data | Multi_point | 5600 | |||||||
| 4301 | |||||||||
| Pseudo_map_position | |||||||||
| Reference | WBPaper00006402 | ||||||||
| WBPaper00006421 | |||||||||
| WBPaper00028970 | |||||||||
| WBPaper00031484 | |||||||||
| WBPaper00038491 | |||||||||
| WBPaper00046184 | |||||||||
| WBPaper00055090 | |||||||||
| WBPaper00061262 | |||||||||
| WBPaper00062515 | |||||||||
| WBPaper00065331 | |||||||||
| Remark | Sequence connection from [Sheps JA, Baillie DL] [040902 ck1] | ||||||||
| Map position created from combination of previous interpolated map position (based on known location of sequence) and allele information. Therefore this is not a genetic map position based on recombination frequencies or genetic experiments. This was done on advice of the CGC. | CGC_data_submission | ||||||||
| Method | Gene |
