WormBase Tree Display for Gene: WBGene00000743
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WBGene00000743 | Evidence | Person_evidence | WBPerson345 | ||||||
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WBPerson651 | |||||||||
SMap | S_parent | Sequence | T10E10 | ||||||
Identity | Version | 1 | |||||||
Name | CGC_name | col-170 | Person_evidence | WBPerson345 | |||||
Sequence_name | T10E10.6 | ||||||||
Molecular_name | T10E10.6 | ||||||||
T10E10.6.1 | |||||||||
CE23972 | |||||||||
Other_name | T10E10.e | Curator_confirmed | WBPerson1983 | ||||||
Remark | Old cosmid naming mapped via unique overlapping PCR_product on CDSs | ||||||||
CELE_T10E10.6 | Accession_evidence | NDB | BX284606 | ||||||
Public_name | col-170 | ||||||||
DB_info | Database | AceView | gene | XG951 | |||||
WormQTL | gene | WBGene00000743 | |||||||
WormFlux | gene | WBGene00000743 | |||||||
NDB | locus_tag | CELE_T10E10.6 | |||||||
Panther | gene | CAEEL|WormBase=WBGene00000743|UniProtKB=Q86NE3 | |||||||
family | PTHR24637 | ||||||||
NCBI | gene | 353462 | |||||||
RefSeq | protein | NM_001381007.1 | |||||||
TrEMBL | UniProtAcc | Q86NE3 | |||||||
UniProt_GCRP | UniProtAcc | Q86NE3 | |||||||
Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
History | Version_change | 1 | 07 Apr 2004 11:29:21 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from geneace | ||
Status | Live | ||||||||
Gene_info | Biotype | SO:0001217 | |||||||
Gene_class | col | ||||||||
Allele (14) | |||||||||
RNASeq_FPKM (74) | |||||||||
GO_annotation | 00083489 | ||||||||
00083490 | |||||||||
00083491 | |||||||||
00107730 | |||||||||
Ortholog (68) | |||||||||
Paralog (163) | |||||||||
Structured_description | Automated_description | Predicted to be a structural constituent of cuticle. Predicted to be located in membrane. Predicted to be part of collagen trimer. | Paper_evidence | WBPaper00065943 | |||||
Curator_confirmed | WBPerson324 | ||||||||
WBPerson37462 | |||||||||
Inferred_automatically | This description was generated automatically by a script based on data from the WS291 version of WormBase | ||||||||
Date_last_updated | 29 Nov 2023 00:00:00 | ||||||||
Molecular_info | Corresponding_CDS | T10E10.6 | |||||||
Corresponding_transcript | T10E10.6.1 | ||||||||
Other_sequence | BXC03447_1 | ||||||||
SSC02271_1 | |||||||||
ALC00141_1 | |||||||||
SS00047 | |||||||||
SSC02626_1 | |||||||||
OOC00238_1 | |||||||||
WBC01438_1 | |||||||||
GP02854 | |||||||||
FC816343.1 | |||||||||
JI176031.1 | |||||||||
SRC00761_2 | |||||||||
SSC01124_1 | |||||||||
HC05453 | |||||||||
PTC00609_1 | |||||||||
SSC00462_2 | |||||||||
CJC03464_1 | |||||||||
GPC02745_1 | |||||||||
HG08236 | |||||||||
PT00442 | |||||||||
BU586543.1 | |||||||||
BUC00394_1 | |||||||||
HG11476 | |||||||||
FC810890.1 | |||||||||
FD515185.1 | |||||||||
GP00453 | |||||||||
SS01595 | |||||||||
FK670299.1 | |||||||||
EX012310.1 | |||||||||
BXC01624_1 | |||||||||
GPC01347_2 | |||||||||
BUC00332_1 | |||||||||
CRC08182_1 | |||||||||
HG03459 | |||||||||
HG01505 | |||||||||
GP01277 | |||||||||
Tcol_isotig23722 | |||||||||
XI03149 | |||||||||
PP02336 | |||||||||
FK670294.1 | |||||||||
CJC10586_1 | |||||||||
CK850084.1 | |||||||||
FC810269.1 | |||||||||
GP00417 | |||||||||
MIC08633_1 | |||||||||
CSC00938_1 | |||||||||
GP00448 | |||||||||
FD517168.1 | |||||||||
OVC00762_1 | |||||||||
GPC00856_1 | |||||||||
SS00038 | |||||||||
ACC08128_1 | |||||||||
AS03637 | |||||||||
AM743997.1 | |||||||||
GPC00113_1 | |||||||||
BUC00366_1 | |||||||||
PTC01320_1 | |||||||||
FF682079.1 | |||||||||
SS01639 | |||||||||
HC02265 | |||||||||
ES743771.1 | |||||||||
JI175809.1 | |||||||||
JI169543.1 | |||||||||
SS01363 | |||||||||
EX911969.1 | |||||||||
CR11825 | |||||||||
GP00504 | |||||||||
HGC00517_1 | |||||||||
BG467876.1 | |||||||||
CK854652.1 | |||||||||
NAC00580_1 | |||||||||
BU586408.1 | |||||||||
Oden_isotig12453 | |||||||||
HCC00204_1 | |||||||||
AS02810 | |||||||||
TDC02684_1 | |||||||||
ES744613.1 | |||||||||
SS01572 | |||||||||
PT02814 | |||||||||
FC811948.1 | |||||||||
EX011729.1 | |||||||||
HG03433 | |||||||||
HCC07083_1 | |||||||||
CSC01094_1 | |||||||||
EX914906.1 | |||||||||
PPC00816_1 | |||||||||
MH04016 | |||||||||
BXC02421_1 | |||||||||
Tcir_isotig17798 | |||||||||
CBC01251_1 | |||||||||
NAC00184_1 | |||||||||
FC811611.1 | |||||||||
GP01432 | |||||||||
BU586279.1 | |||||||||
CBC08273_1 | |||||||||
HG11885 | |||||||||
HBC00923_1 | |||||||||
Associated_feature | WBsf648226 | ||||||||
WBsf235830 | |||||||||
Experimental_info | RNAi_result | WBRNAi00026228 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||
Expr_pattern | Expr1024411 | ||||||||
Expr1030453 | |||||||||
Expr1156656 | |||||||||
Expr2010364 | |||||||||
Drives_construct | WBCnstr00037315 | ||||||||
Construct_product | WBCnstr00037315 | ||||||||
Microarray_results (12) | |||||||||
Expression_cluster (244) | |||||||||
Interaction (14) | |||||||||
Map_info | Map | X | Position | -3.06173 | |||||
Positive | Positive_clone | T10E10 | Inferred_automatically | From CDS info | |||||
From sequence, transcript, pseudogene data | |||||||||
Pseudo_map_position | |||||||||
Reference | WBPaper00038491 | ||||||||
WBPaper00055090 | |||||||||
WBPaper00064788 | |||||||||
Remark | Map position created from combination of previous interpolated map position (based on known location of sequence) and allele information. Therefore this is not a genetic map position based on recombination frequencies or genetic experiments. This was done on advice of the CGC. | CGC_data_submission | |||||||
Method | Gene |