WormBase Tree Display for Gene: WBGene00000187
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| WBGene00000187 | SMap | S_parent | Sequence | F54C9 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identity | Version | 1 | |||||||
| Name | CGC_name | arl-1 | |||||||
| Sequence_name | F54C9.10 | ||||||||
| Molecular_name | F54C9.10 | ||||||||
| F54C9.10.1 | |||||||||
| CE02250 | |||||||||
| Other_name | CELE_F54C9.10 | Accession_evidence | NDB | BX284602 | |||||
| Public_name | arl-1 | ||||||||
| DB_info | Database | AceView | gene | 2I873 | |||||
| WormQTL | gene | WBGene00000187 | |||||||
| WormFlux | gene | WBGene00000187 | |||||||
| NDB | locus_tag | CELE_F54C9.10 | |||||||
| Panther | gene | CAEEL|WormBase=WBGene00000187|UniProtKB=Q20758 | |||||||
| family | PTHR11711 | ||||||||
| NCBI | gene | 174375 | |||||||
| RefSeq | protein | NM_063415.7 | |||||||
| SwissProt | UniProtAcc | Q20758 | |||||||
| TREEFAM | TREEFAM_ID | TF105461 | |||||||
| UniProt_GCRP | UniProtAcc | Q20758 | |||||||
| Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
| History | Version_change | 1 | 07 Apr 2004 11:29:20 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from geneace | ||
| Status | Live | ||||||||
| Gene_info (11) | |||||||||
| Molecular_info | Corresponding_CDS | F54C9.10 | |||||||
| Corresponding_transcript | F54C9.10.1 | ||||||||
| Other_sequence | HG04090 | ||||||||
| HG05517 | |||||||||
| TS00800 | |||||||||
| HGC10853_1 | |||||||||
| EX545912.1 | |||||||||
| Acan_isotig11300 | |||||||||
| Oden_isotig13423 | |||||||||
| HG06115 | |||||||||
| ES739598.1 | |||||||||
| EX538457.1 | |||||||||
| Hbac_isotig05857 | |||||||||
| SR01161 | |||||||||
| JI211689.1 | |||||||||
| TVC00038_1 | |||||||||
| Tcol_isotig07088 | |||||||||
| TV00671 | |||||||||
| EX545076.1 | |||||||||
| PPC04782_1 | |||||||||
| HC00021 | |||||||||
| NAC00215_1 | |||||||||
| MI07771 | |||||||||
| EX502547.1 | |||||||||
| SRC00106_1 | |||||||||
| HC00717 | |||||||||
| HCC03026_1 | |||||||||
| HBC10493_1 | |||||||||
| EY462751.1 | |||||||||
| Oden_isotig20566 | |||||||||
| TSC00933_1 | |||||||||
| Oden_isotig13424 | |||||||||
| Tcol_isotig07089 | |||||||||
| ACC09470_1 | |||||||||
| HGC06287_1 | |||||||||
| TSC10875_1 | |||||||||
| NB12399 | |||||||||
| NBC09158_1 | |||||||||
| MIC07057_1 | |||||||||
| GR15860 | |||||||||
| Dviv_isotig22972 | |||||||||
| Oden_isotig28133 | |||||||||
| PPC11576_1 | |||||||||
| PPC05637_1 | |||||||||
| EX536673.1 | |||||||||
| Tcol_isotig07087 | |||||||||
| JI465034.1 | |||||||||
| BXC03506_1 | |||||||||
| ES570577.1 | |||||||||
| PP01083 | |||||||||
| SS02675 | |||||||||
| HCC03257_1 | |||||||||
| JI473511.1 | |||||||||
| TM02826 | |||||||||
| HG05518 | |||||||||
| SSC04510_1 | |||||||||
| Tcir_isotig08313 | |||||||||
| HC01478 | |||||||||
| TMC04287_1 | |||||||||
| HC01481 | |||||||||
| Associated_feature | WBsf221781 | ||||||||
| WBsf221782 | |||||||||
| Experimental_info | RNAi_result | WBRNAi00114585 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||
| WBRNAi00025619 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00093196 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00062562 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00099103 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00071186 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00048268 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00008847 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00032761 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| WBRNAi00083360 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| Expr_pattern | Chronogram403 | ||||||||
| Expr3152 | |||||||||
| Expr6170 | |||||||||
| Expr11058 | |||||||||
| Expr1011695 | |||||||||
| Expr1030110 | |||||||||
| Expr1152069 | |||||||||
| Expr2009400 | |||||||||
| Expr2027636 | |||||||||
| Drives_construct | WBCnstr00003920 | ||||||||
| WBCnstr00008156 | |||||||||
| WBCnstr00011180 | |||||||||
| WBCnstr00037677 | |||||||||
| Construct_product | WBCnstr00008156 | ||||||||
| WBCnstr00011180 | |||||||||
| WBCnstr00037677 | |||||||||
| Microarray_results (21) | |||||||||
| Expression_cluster (94) | |||||||||
| Interaction (84) | |||||||||
| Map_info | Map | II | Position | 0.823012 | Error | 0.000979 | |||
| Positive | Positive_clone | F54C9 | Inferred_automatically | From sequence, transcript, pseudogene data | |||||
| Mapping_data | Multi_point | 5252 | |||||||
| 4613 | |||||||||
| 5670 | |||||||||
| Pseudo_map_position | |||||||||
| Reference (12) | |||||||||
| Remark | Map position created from combination of previous interpolated map position (based on known location of sequence) and allele information. Therefore this is not a genetic map position based on recombination frequencies or genetic experiments. This was done on advice of the CGC. | CGC_data_submission | |||||||
| Method | Gene |
