WormBase Tree Display for Sequence: M02H5
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M02H5 | DNA | M02H5 | 35420 | |||
---|---|---|---|---|---|---|
SMap | S_child | Gene_child (11) | ||||
CDS_child (323) | ||||||
Transcript (19) | ||||||
Genomic_non_canonical | WRM0633bB03 | 444 | 17014 | |||
PCR_product | cenix:109-h2 | 3057 | 3951 | |||
cenix:118-f1 | 30572 | 31951 | ||||
cenix:164-d5 | 7996 | 8899 | ||||
cenix:164-f5 | 5405 | 6976 | ||||
cenix:164-g5 | 25796 | 27259 | ||||
cenix:228-b6 | 107 | 381 | ||||
cenix:61-a10 | 25027 | 25632 | ||||
cenix:61-b10 | 19184 | 19856 | ||||
cenix:65-a5 | 21348 | 22125 | ||||
cenix:70-a8 | 9780 | 10776 | ||||
cenix:88-f3 | 12492 | 14139 | ||||
mv_M02H5.a | 25850 | 26520 | ||||
mv_M02H5.b | 400 | 1573 | ||||
mv_M02H5.c | 8302 | 8660 | ||||
mv_M02H5.d | 9735 | 11928 | ||||
mv_M02H5.e | 12624 | 14951 | ||||
mv_M02H5.f | 18175 | 25651 | ||||
mv_M02H5.g | 31444 | 32899 | ||||
mv_M02H5.h | 33091 | 35382 | ||||
p_M02H5.1_93 | 32790 | 33089 | ||||
p_M02H5.7_93 | 8661 | 9733 | ||||
p_M02H5.8_93 | 7510 | 8300 | ||||
sjj2_M02H5.1 | 33092 | 33990 | ||||
sjj2_M02H5.10 | 3471 | 4154 | ||||
sjj2_M02H5.12 | 25797 | 26916 | ||||
sjj2_M02H5.2 | 31136 | 31669 | ||||
sjj2_M02H5.3 | 24445 | 25632 | ||||
sjj2_M02H5.4 | 21172 | 22074 | ||||
sjj2_M02H5.5 | 18353 | 19538 | ||||
sjj2_M02H5.6 | 14322 | 15433 | ||||
sjj2_M02H5.9 | 701 | 1466 | ||||
sjj_M02H5.a | 25824 | 26952 | ||||
sjj_M02H5.b | 7332 | 8904 | ||||
sjj_M02H5.c | 9661 | 11932 | ||||
sjj_M02H5.d | 12840 | 14946 | ||||
sjj_M02H5.e | 23674 | 25617 | ||||
sjj_M02H5.f | 31296 | 32889 | ||||
sjj_M02H5.g | 32983 | 35129 | ||||
Allele (1455) | ||||||
Oligo_set | Aff_M02H5.A | 26500 | 25848 | |||
Aff_M02H5.B | 8301 | 8662 | ||||
Aff_M02H5.C | 10555 | 11930 | ||||
Aff_M02H5.D | 13736 | 14953 | ||||
Aff_M02H5.E | 24919 | 25653 | ||||
Aff_M02H5.F | 31563 | 32813 | ||||
Aff_M02H5.G | 33473 | 34920 | ||||
Feature_object (216) | ||||||
Feature_data | M02H5:Polysome | 1 | 35420 | |||
M02H5:TranscriptionallyActiveRegion | 1 | 35420 | ||||
M02H5:ChIPSeqTF | 1 | 35420 | ||||
M02H5:TRF | 1 | 35420 | ||||
M02H5:Dust | 1 | 35420 | ||||
M02H5:inverted | 1 | 35420 | ||||
Homol_data (19) | ||||||
Structure | From | Source | CHROMOSOME_V | |||
Overlap_right | T01G6 | 35021 | ||||
Overlap_left | B0554 | |||||
Clone_left_end | T01G6 | 35021 | ||||
M02H5 | 597 | |||||
Clone_right_end | B0554 | 18117 | ||||
DB_info | Database | EMBL | NDB_AC | FO080236 | ||
NDB_ID | _AC006675 | |||||
NDB_SV | FO080236.1 | |||||
Secondary_accession | AC006675 | |||||
DB_remark | The 5' clone is B0554, 600 bp overlap; the 3' clone is T01G6, 400 bp overlap. Actual start of this clone is at base position 597 of M02H5; actual end is at 9736 of T01G6. | |||||
Keyword | HTG | |||||
EMBL_dump_info | EMBL_dump_method | worm_EMBL-dump | ||||
Origin | From_author | Bradshaw-Cordum H | ||||
From_laboratory | RW | |||||
Date | 29 Jul 1999 00:00:00 | |||||
Date_directory | ||||||
Species | Caenorhabditis elegans | |||||
Visible | Clone | M02H5 | ||||
Properties | Genomic_canonical | |||||
Checksum | MD5 | e5fe0cb55aab7ea78c17da5c4f75ebdd | ||||
Status | Finished | |||||
Submitted | 29 Jul 1999 00:00:00 | |||||
Map | Sequence-V | |||||
Interpolated_map_position | V | -19.9931 | ||||
Method | Genomic_canonical |