WormBase Tree Display for RNAi: WBRNAi00059920
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| WBRNAi00059920 | Homol | Homol_homol | CHROMOSOME_I:RNAi | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Sequence_info | DNA_text | tcacatttcaaaagatcgttcaaaatcaatatcaaaagacgatataatgattgaaacactgacatcagaacaagcagcatcacatgaagttgttccatgtacacatcaacttcgaacaaatcttgaagagggtctcacaacggcagaagccacaagaaggagacaatatcatggatataatgaatttgatgttggagaagaggaacctatttataaaaaatatttggaacaattccaaaatccattgattcttctcttattggcttctgcatttgtgtcgattgttatgaaacaatatgatgatgcgatatcgattacggtagctgttgtcatagttgttactgttggatttgtgcaggtaactacaaactacaaactacaaactacaaactacaaataggtgttgaaaagtttaaattttttcgatgtttttcggagaaaatcgaaaaaaaaatttcgatttttttgaaaatcggaaaacttgttcaaaaagttataattattttgaatatgttgaattttagctaaaatcaaggatttttttctgaatttttccaattttttttccaaaaatcgaaaagaaacacaaaaattcggaaaaacggaaaattttagacttttttaaaatgaaaatccagaaaaaaattgtaaagaactatatatttattaaaaaaaaaaaaaaaaaacggaaaaaaacagtaaaattcaaaaaaaaaatttttttttgatttttttgaaaattgaagaaaaattatttaaaaaatatttttttaatcaaaaaataaaattttttggaattttggaatttttcccaacaaaaaacacacaaaatacgaaaaaacgaaaaatgttcgattttgtttttcaaaagtttagacttttttgacgattttttagaaaaattcgatgtgttcaaatcttgtagtttgtagtctcaaattgactacaaactataaagtataacttttctttatcatttgaaaaagttcaacttttgtagaacagataagaaactacaaactattgggaatatattatttcgataaaaatttggaagtttgtttacaatgttatgaatgatgatgtcatgtgtaaaaattgtgggagcatagactacaaactacaaactacaaactacaaactacagtacaacgtcaaaatttttaaaaacgattcaagatgctaatccctccatttttccaggaataccgttccgaaaagacgctggaacaactcaccaaactcgttccaccaacgtgtcacgtgctccgtgatggaaaagaggcaatgatgttggctcgggagcttgtacccggtgatattgtacttctgaacacgggagatcggatcccgtccgatttacgaatcgccgagagcttctcacttcaaatcgacgagagctcactgaccggagaaactgagccgaagcataaggtttgtaatttgtagtttgtggtttgtagtttatagtctagactccaacaacctctttccaggaaacccgttcagtgccggccgcatctgccaccggatccgatgttgaacatctcacatgcatcgccttcatgggaactcttgtctgcgctggccgtggccgaggaatcgtcatttcgacggccgccaattcacagtttggagaagtggtaaagatgatgatgggtgaggagtctccgaagactccactgcaaaagagtatggatgatctgggaaagcagctttcgatctactcatttggcgtcatcgccgttattttcctaatcggaatgtttcaggtactgctgggttactgtaggttactgtagagtttgtagcttgtagtcacgttggagtttagtaagctggtggtctttgtagatttacgaaatttggaaaaattccatcaaatcggcaaattgccagaattgaaaatttcggcaattcggcaaattgacaatttactgaaaattaaaaattccggcaaatcggcaaaccggcaattattaaaaaatttcggaaaataggcaaattgccggaattaaaaatttcggaaaataggcatattgccggaattgaaaaatgcaggcaaatcggcatattgccggaattgaaaaatgcaggcaaatcggcaaattgccggaattgaaaattttcggcaaatcggcaaaccggtaaattgccggaattgaaaattagctgcaaattgccaaattgccggaattgaaaattttcggcaaatcggcaaaccggtaaattgccggaattaaaattttccggcaaataggtaaattgccagaattgaaaatttcggcaattcggcaaattgacaatttactgaaaacaaaaaattccggcaaatcggcaaaccggcaattattaaaaaatttcggaaaataggcaaattgccggaattaaaaattttgggcaaatcggaaaattgccggacatgagaatttccggcaaatcggcatattgccggaattgaaaattttcggcaaatcggcaaaccggtaaattgccggaattgaaaattagctgcaaattgccggaattgaacatttccgacaaatcggtaaattgccggaattgaaaattttcggcaaaccggtaaattgccggaattgaaaatttccggcaaatcggaaaattgccggaattaaaattttccggcaaatcggtaaattgccggaattaaaaattacatagatagttagaggggacagacatccgggacccaatggggcggggcgcgtggtagagacgatttgtgtcgatttacgaaattttcctcgttgtcattatttcgtaaatcgacacaaatcatctcttccgcgcgccccgcctcattgggtcccggatgtctgtcccttctaactatctacactctctgtaccggtaatatagaaatgaacaaataaattgttagctggcatgccaaaattgccaaaattgaattcctactagacttagtgtagattcagagatatattatcgaattttccaatttccagggtcgaaatgtggttgatatgttcacaattggtgtctccctcgccgtcgctgcaattcctgaaggtcttccaatcgtagttgccgtaacactagcaatcggagtaatgagaatggccaaacgcagagctgtcgtgaagaagatgccagcagtcgagactctcggatgtgtaacagtaatatgttcggataaaactggaacactgacaaaaaatgagatgacagcacaagccatcgctacaccagaaggaaaactcgctgaaatcactggaatcggatattcagcagaaggaggtgttgttcagtatcaaggagaacaagttcatcaatggacacatccagaatttgcgagaattattgaagctggattagtttgtaataatgctactattgaagcggataagcttatcggacaacccacggagggagcaattgtagtgttggcaaagaaagcacagttggaaggagtacgatcagagtataagagacttcgagaaatgccattctcttcagatactaaatggatgggggttcagtgtgctgatgcacatgggcagaatgtttattttattaaaggtacattgaaattatggaaattggattcaattaattagattagattacaaaccaggcaaaaagcggaaaatcggttccggcaaatcggcaaattgccggaattgaaatttccggcaaatcggcaatttgccggaatttaacttccctatgctaatatatgcatagttgttgtttgttttcaaatttgactgtgagaattacattgtagtttatagtgtgtgaaccaggggtgggcggcaattttttgtcgacaaattcggcaaaacggtaaactgccggcttgccgatttgccggaaatgtagattttcggcaaattgccgatttgccggatataaattttttccattttactttagatattttcatagaatttgcttacttttcaaaataaatgtgggaacattcatatttaggaggcgtacaaatcgaaaatttgccggtttgccgatttgccagaaattttcgatttcggcaatttgcccaaatttttgaattccggcaatttaccgatttgccggaaatttttgaattccggcaagttgccgatttgccggaaagttttgaattccggcaagttgccgatttgccggaaatttttaattccggcaattggcgaatttgccggtttgccggaaatttttgaattccggcaagttgccgatttgccggaaatttataattccggcaattggcgaatttgccggtttgccggaaacttttgaattccggcaagttgccgatttgccggaaatttttaattccggcaattggcgaatttgccggtttgccggaaatttttgaattccggcaagttgccgatttgccggaaattttcaattccggcaattggcgaatttgccgatttgccagaaacttttgaattccggcaagttgccgatttgccggaaatttttaattccggcaattggcgaatttgccggtttgccggaaatttttgaattccggcaagttgccgatttgccggaaatttataattccggcaattggcgaatttgccggtttgccggaaacttttgaattccggcaagttgccgatttgccggaaatttttaattccggcaattggcgaatttgccggtttgccggaaatttttgaattccggcaagttgccgatttgccagaaattttcaattccggcaattggcgaatttgccggtttgccggaaatttttgaattccggcaagttgccgatttgccggaaattttcaattccggcaattggcgaatttgccggtttgccggaaatttttgaattccggcaagttgccgatttgccggaaatttttaattccggcaatttaccgatttgccggaaatttttgaattccggcaatttaccgatttgccggaaatttttgaattccggcaagttgccgatttgccagaaattttcaattccggcaattggcgaattt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| yk218a11 | ||
| Experiment | Laboratory | KJ | |||
| Date | 09 Dec 2004 00:00:00 | ||||
| Genotype | daf-16(m26) | ||||
| Treatment | To examine sensitivity to paraquat, young adults were transferred from normal nematode growth media (NGM) plates into three different plates each containing 2 mM paraquat. Worms were incubated at 20 C, and the number of dead animal was counted by observing the cease of movement and pharyngeal pumping. | ||||
| Delivered_by | Injection | ||||
| Inhibits | Predicted_gene | ZK256.1c | Inferred_automatically | RNAi_primary | |
| ZK256.1b | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||
| ZK256.1a | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||
| Gene | WBGene00004063 | Inferred_automatically | RNAi_primary | ||
| Transcript | ZK256.1a.2 | Inferred_automatically | RNAi_primary | ||
| ZK256.1a.1 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||
| ZK256.1a.3 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||
| ZK256.1c.1 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||
| ZK256.1b.1 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||
| Species | Caenorhabditis elegans | ||||
| Reference | WBPaper00024915 | ||||
| Phenotype | WBPhenotype:0000067 | Remark | pmr-1 RNAi treatment increased the survival rate of daf-16 worms on 2 mM paraquat plates up to 25% (daf-16, 1.9 +- 0.2 days, daf-16; pmr-1 RNAi; 2.4 +- 0.3 days). | ||
| Remark | Entire sequence of clone used for RNAi not known as only the ends of the sequence were determined. The only target shown is the best match. | ||||
| Method | RNAi |
