WormBase Tree Display for Gene: WBGene00016892
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| WBGene00016892 | SMap | S_parent | Sequence | C53A3 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identity | Version | 2 | |||||||
| Name | CGC_name | pgph-3 | Person_evidence | WBPerson1352 | |||||
| Sequence_name | C53A3.2 | ||||||||
| Molecular_name | C53A3.2 | ||||||||
| C53A3.2.1 | |||||||||
| CE16942 | |||||||||
| Other_name | CELE_C53A3.2 | Accession_evidence | NDB | BX284605 | |||||
| Public_name | pgph-3 | ||||||||
| DB_info | Database | AceView | gene | 5G242 | |||||
| WormQTL | gene | WBGene00016892 | |||||||
| WormFlux | gene | WBGene00016892 | |||||||
| NDB | locus_tag | CELE_C53A3.2 | |||||||
| Panther | gene | CAEEL|WormBase=WBGene00016892|UniProtKB=O44538 | |||||||
| family | PTHR19288 | ||||||||
| NCBI | gene | 178964 | |||||||
| RefSeq | protein | NM_072110.6 | |||||||
| TrEMBL | UniProtAcc | O44538 | |||||||
| UniProt_GCRP | UniProtAcc | O44538 | |||||||
| Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
| History | Version_change | 1 | 28 May 2004 13:30:58 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from CDS class of stlace from WS125 | ||
| Name_change | CGC_name | pgph-3 | |||||||
| 2 | 23 Sep 2018 21:25:24 | WBPerson1983 | Name_change | CGC_name | pgph-3 | ||||
| Status | Live | ||||||||
| Gene_info (8) | |||||||||
| Molecular_info | Corresponding_CDS | C53A3.2 | |||||||
| Corresponding_transcript | C53A3.2.1 | ||||||||
| Other_sequence | EV854173.1 | ||||||||
| GO238866.1 | |||||||||
| DR121004.1 | |||||||||
| GO239017.1 | |||||||||
| FD514556.1 | |||||||||
| GO238882.1 | |||||||||
| BU088311.1 | |||||||||
| JI165238.1 | |||||||||
| TSC04756_1 | |||||||||
| BU088402.1 | |||||||||
| MH05907 | |||||||||
| GO238977.1 | |||||||||
| CJC08304_1 | |||||||||
| GO238927.1 | |||||||||
| BU087217.1 | |||||||||
| MHC02276_1 | |||||||||
| JO468926.1 | |||||||||
| GO238940.1 | |||||||||
| JI171152.1 | |||||||||
| SSC00937_1 | |||||||||
| GO238881.1 | |||||||||
| NAC02194_1 | |||||||||
| TS05576 | |||||||||
| ES562355.1 | |||||||||
| Dviv_isotig28702 | |||||||||
| FK808155.1 | |||||||||
| GO238919.1 | |||||||||
| BXC00407_1 | |||||||||
| MAC02323_1 | |||||||||
| GO238879.1 | |||||||||
| GO238860.1 | |||||||||
| FE916217.1 | |||||||||
| GO238930.1 | |||||||||
| FK801508.1 | |||||||||
| DVC02986_1 | |||||||||
| Dviv_isotig19243 | |||||||||
| Dviv_isotig19244 | |||||||||
| ASC01331_1 | |||||||||
| FK802689.1 | |||||||||
| BU088314.1 | |||||||||
| MA00468 | |||||||||
| SCC00009_1 | |||||||||
| TS05832 | |||||||||
| GO238893.1 | |||||||||
| GO238900.1 | |||||||||
| SS00527 | |||||||||
| GO238907.1 | |||||||||
| BG467638.1 | |||||||||
| GO238968.1 | |||||||||
| FK801956.1 | |||||||||
| GO238863.1 | |||||||||
| FE913766.1 | |||||||||
| GO238865.1 | |||||||||
| FK802097.1 | |||||||||
| GO238937.1 | |||||||||
| GO238971.1 | |||||||||
| GO239027.1 | |||||||||
| CSC01899_1 | |||||||||
| GO238897.1 | |||||||||
| GO239025.1 | |||||||||
| AS00653 | |||||||||
| Associated_feature | WBsf652649 | ||||||||
| WBsf718314 | |||||||||
| WBsf1019684 | |||||||||
| WBsf233721 | |||||||||
| Experimental_info | RNAi_result (11) | ||||||||
| Expr_pattern | Chronogram840 | ||||||||
| Expr5575 | |||||||||
| Expr1018417 | |||||||||
| Expr1037249 | |||||||||
| Expr1147017 | |||||||||
| Expr2001873 | |||||||||
| Expr2020099 | |||||||||
| Drives_construct | WBCnstr00004425 | ||||||||
| WBCnstr00027722 | |||||||||
| Construct_product | WBCnstr00027722 | ||||||||
| Microarray_results (12) | |||||||||
| Expression_cluster (297) | |||||||||
| Interaction (15) | |||||||||
| Map_info | Map | V | Position | -1.00941 | |||||
| Positive | Positive_clone | C53A3 | Inferred_automatically | From sequence, transcript, pseudogene data | |||||
| Pseudo_map_position | |||||||||
| Reference | WBPaper00027108 | ||||||||
| WBPaper00038491 | |||||||||
| WBPaper00055090 | |||||||||
| WBPaper00062352 | |||||||||
| WBPaper00063033 | |||||||||
| WBPaper00065341 | |||||||||
| Remark | Map position created from combination of previous interpolated map position (based on known location of sequence) and allele information. Therefore this is not a genetic map position based on recombination frequencies or genetic experiments. This was done on advice of the CGC. | CGC_data_submission | |||||||
| Method | Gene |
