WormBase Tree Display for Gene: WBGene00003148
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| WBGene00003148 | Evidence | Person_evidence | WBPerson29 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SMap | S_parent | Sequence | CHROMOSOME_IV | ||||||
| Identity | Version | 1 | |||||||
| Name | CGC_name | mbf-1 | Person_evidence | WBPerson29 | |||||
| Sequence_name | H21P03.1 | ||||||||
| Molecular_name | H21P03.1 | ||||||||
| H21P03.1.1 | |||||||||
| CE18819 | |||||||||
| Other_name | CELE_H21P03.1 | Accession_evidence | NDB | BX284604 | |||||
| Public_name | mbf-1 | ||||||||
| DB_info | Database | AceView | gene | 4M244 | |||||
| WormQTL | gene | WBGene00003148 | |||||||
| WormFlux | gene | WBGene00003148 | |||||||
| NDB | locus_tag | CELE_H21P03.1 | |||||||
| Panther | gene | CAEEL|WormBase=WBGene00003148|UniProtKB=Q9XTV4 | |||||||
| family | PTHR10245 | ||||||||
| NCBI | gene | 178071 | |||||||
| RefSeq | protein | NM_069765.8 | |||||||
| TREEFAM | TREEFAM_ID | TF300064 | |||||||
| TrEMBL | UniProtAcc | Q9XTV4 | |||||||
| UniProt_GCRP | UniProtAcc | Q9XTV4 | |||||||
| Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
| History | Version_change | 1 | 07 Apr 2004 11:29:30 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from geneace | ||
| Status | Live | ||||||||
| Gene_info | Biotype | SO:0001217 | |||||||
| Gene_class | mbf | ||||||||
| Allele (22) | |||||||||
| Strain | WBStrain00036428 | ||||||||
| RNASeq_FPKM (74) | |||||||||
| GO_annotation | 00101230 | ||||||||
| 00101231 | |||||||||
| 00101232 | |||||||||
| 00110614 | |||||||||
| Contained_in_operon | CEOP4444 | ||||||||
| Ortholog (34) | |||||||||
| Structured_description | Automated_description | Predicted to enable DNA binding activity. Predicted to be located in nucleus. Expressed in tail. Is an ortholog of human EDF1 (endothelial differentiation related factor 1). | Paper_evidence | WBPaper00065943 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson324 | ||||||||
| WBPerson37462 | |||||||||
| Inferred_automatically | This description was generated automatically by a script based on data from the WS291 version of WormBase | ||||||||
| Date_last_updated | 29 Nov 2023 00:00:00 | ||||||||
| Molecular_info | Corresponding_CDS | H21P03.1 | |||||||
| Corresponding_transcript | H21P03.1.1 | ||||||||
| Other_sequence | ES741510.1 | ||||||||
| Dviv_isotig02823 | |||||||||
| Dviv_isotig02831 | |||||||||
| EX916772.1 | |||||||||
| MH01482 | |||||||||
| Dviv_isotig02825 | |||||||||
| EX008534.1 | |||||||||
| XI01308 | |||||||||
| Dviv_isotig02834 | |||||||||
| SRC02405_1 | |||||||||
| CJC08602_1 | |||||||||
| HCC02822_1 | |||||||||
| ES409711.1 | |||||||||
| NAC01682_1 | |||||||||
| HBC06571_1 | |||||||||
| NBC02930_1 | |||||||||
| CRC02871_1 | |||||||||
| SSC00580_1 | |||||||||
| Dviv_isotig02830 | |||||||||
| Hbac_isotig04529 | |||||||||
| GPC01795_1 | |||||||||
| HCC13278_1 | |||||||||
| FC812050.1 | |||||||||
| Tcir_isotig05531 | |||||||||
| Dviv_isotig02833 | |||||||||
| OVC01072 | |||||||||
| MH00552 | |||||||||
| JI225793.1 | |||||||||
| Dviv_isotig02819 | |||||||||
| NAC00720_1 | |||||||||
| Dviv_isotig02837 | |||||||||
| Dviv_isotig02821 | |||||||||
| HGC03219_1 | |||||||||
| HC04373 | |||||||||
| Dviv_isotig02822 | |||||||||
| Tcol_isotig17395 | |||||||||
| Dviv_isotig02827 | |||||||||
| XI01090 | |||||||||
| JI174449.1 | |||||||||
| Name_isotig02410 | |||||||||
| Dviv_isotig02840 | |||||||||
| Oden_isotig18196 | |||||||||
| CBC02112_1 | |||||||||
| JI223333.1 | |||||||||
| MHC00094_1 | |||||||||
| BU665940.1 | |||||||||
| Dviv_isotig02812 | |||||||||
| Dviv_isotig02828 | |||||||||
| HG00946 | |||||||||
| Dviv_isotig02818 | |||||||||
| EX913010.1 | |||||||||
| BU087315.1 | |||||||||
| EX010773.1 | |||||||||
| XIC00153_1 | |||||||||
| ES741792.1 | |||||||||
| Dviv_isotig02814 | |||||||||
| GP02445 | |||||||||
| NB06929 | |||||||||
| MHC10586_1 | |||||||||
| Acan_isotig14399 | |||||||||
| HBC07996_1 | |||||||||
| Dviv_isotig02816 | |||||||||
| ACC28179_1 | |||||||||
| NB06807 | |||||||||
| GO248980.1 | |||||||||
| Dviv_isotig02842 | |||||||||
| HC00672 | |||||||||
| ES741202.1 | |||||||||
| EX556171.1 | |||||||||
| XIC00137_1 | |||||||||
| BXC00286_1 | |||||||||
| Dviv_isotig02839 | |||||||||
| JI173209.1 | |||||||||
| Dviv_isotig02835 | |||||||||
| CR08173 | |||||||||
| AA294722.1 | |||||||||
| PPC03693_1 | |||||||||
| SS02012 | |||||||||
| Associated_feature | WBsf652216 | ||||||||
| WBsf668331 | |||||||||
| WBsf981823 | |||||||||
| WBsf230884 | |||||||||
| Gene_product_binds (70) | |||||||||
| Transcription_factor | WBTranscriptionFactor001030 | ||||||||
| Experimental_info | RNAi_result (3) | ||||||||
| Expr_pattern | Expr6279 | ||||||||
| Expr1022740 | |||||||||
| Expr1031484 | |||||||||
| Expr1153178 | |||||||||
| Expr1200138 | |||||||||
| Expr2013430 | |||||||||
| Expr2031664 | |||||||||
| Drives_construct | WBCnstr00002492 | ||||||||
| WBCnstr00036217 | |||||||||
| Construct_product | WBCnstr00016780 | ||||||||
| WBCnstr00016814 | |||||||||
| WBCnstr00016815 | |||||||||
| WBCnstr00036217 | |||||||||
| Microarray_results (19) | |||||||||
| Expression_cluster (148) | |||||||||
| Interaction (43) | |||||||||
| Map_info | Map | IV | Position | 4.98838 | Error | 0.000462 | |||
| Positive | Positive_clone | H21P03 | Inferred_automatically | From CDS info | |||||
| From sequence, transcript, pseudogene data | |||||||||
| Pseudo_map_position | |||||||||
| Reference | WBPaper00038491 | ||||||||
| WBPaper00055090 | |||||||||
| WBPaper00061738 | |||||||||
| Remark | The naming of the locus mbf-1 is based on its high similarity with mbf1 gene in human, Drosophila, yeast, plant | Person_evidence | WBPerson29 | ||||||
| Map position created from combination of previous interpolated map position (based on known location of sequence) and allele information. Therefore this is not a genetic map position based on recombination frequencies or genetic experiments. This was done on advice of the CGC. | CGC_data_submission | ||||||||
| Method | Gene |
